ena-DATASET-U938-16-05-2016-13:27:26:420-145 样本集
该数据集来自 omicsdi.org,属于肿瘤 / 急性髓系白血病分类,主题标签为 Genomics。数据内容为急性髓系白血病患者确诊时靶向重测序产生的原始数据(fastq 文件),可用于分析患者诊断阶段的基因组变异特征,支持白血病相关研究中的分类、变异识别等下游分析(来源 omicsdi.org)

基本信息
资源简介
ena-DATASET-U938-16-05-2016-13:27:26:420-145 样本集
ena-DATASET-U938-16-05-2016-13:27:26:420-145 - samples 是一个收录于 omicsdi.org 的肿瘤相关数据集,归属于急性髓系白血病分类,主题标签为 Genomics。该数据集的核心内容为急性髓系白血病患者确诊时靶向重测序所产生的原始数据,文件形式为 fastq。这些原始测序数据可用于分析患者诊断阶段的基因组变异特征,并支持白血病相关研究中的分类、变异识别等下游分析。整体而言,该数据集面向基因组学与肿瘤学研究场景,为急性髓系白血病在诊断节点的分子特征研究提供原始数据基础。
【数据集背景】
该数据集来自 omicsdi.org,属于肿瘤 / 急性髓系白血病分类,主题标签为 Genomics。急性髓系白血病是一种血液系统恶性肿瘤,针对该类疾病在确诊阶段开展基因组层面的研究,有助于理解其分子特征。该数据集正是在这一背景下,提供急性髓系白血病患者确诊时的靶向重测序原始数据,服务于肿瘤基因组学相关研究。
【数据内容】
数据内容为急性髓系白血病患者确诊时靶向重测序产生的原始数据,具体为 fastq 文件。这些原始数据可用于分析患者诊断阶段的基因组变异特征,并支持白血病相关研究中的分类、变异识别等下游分析。数据集英文名中包含 “samples” 字样,表明其以样本为单位组织数据。除上述内容外,源站未提供关于样本数量、测序平台、靶向区域范围、文件数量等更细化的信息。
【采集与来源】
该数据集来源于 omicsdi.org。根据源站描述,其数据为急性髓系白血病患者确诊时靶向重测序的原始数据(fastq 文件)。关于具体的采集机构、采集时间、采集地点、患者招募方式及样本处理流程等信息,源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于肿瘤 / 急性髓系白血病相关的基因组学研究。具体而言,可用于分析急性髓系白血病患者诊断阶段的基因组变异特征,支持白血病相关研究中的分类、变异识别等下游分析。其原始 fastq 文件形式也便于研究者根据自身分析流程进行后续的比对、变异检测与注释等处理。关于其他具体应用场景,源站未提供。
【使用方法】
该数据集以 fastq 文件形式提供急性髓系白血病患者确诊时靶向重测序的原始数据,使用者可基于这些原始测序数据开展下游分析,例如基因组变异特征分析、白血病相关分类与变异识别等。关于具体的下载方式、数据处理流程、推荐分析工具及参数设置等信息,源站未提供。
【质量与限制】
该数据集为靶向重测序的原始数据,属于 fastq 文件形式。关于数据质量评分、覆盖度、测序深度、样本纳入与排除标准、批次效应及潜在偏差等信息,源站未提供。使用者在使用时需注意,该数据集仅覆盖急性髓系白血病患者确诊阶段,其结论适用范围可能受此限制。其他质量与限制相关信息,源站未提供。
【引用与许可】
关于该数据集的引用方式、许可协议、使用条款及数据访问权限等信息,源站未提供。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://omicsdi.org/dataset/ega/EGAD00001002117
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
Raw data (fastq files) from targeted resequencing of AML patients at diagnosis
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