ena-DATASET-POL-28-08-2017-03:31:43:967-713 - samples 数据集

该数据集来自 omicsdi.org,属于肿瘤领域的急性髓系白血病(AML)研究数据。数据为2015年全外显子测序的AML样本,比对到人类参考基因组 human_g1k_v37.fasta

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基因组分类Genomics
ena-DATASET-POL-28-08-2017-03:31:43:967-713 - samples

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-08

资源简介

ena-DATASET-POL-28-08-2017-03:31:43:967-713 - samples 数据集

该数据集来自 omicsdi.org,属于肿瘤领域的急性髓系白血病(AML)研究数据,主题标签为 Genomics。数据为 2015 年全外显子测序的 AML 样本,比对到人类参考基因组 human_g1k_v37.fasta。数据集英文名称为 ena-DATASET-POL-28-08-2017-03:31:43:967-713 - samples。整体来看,该数据集围绕急性髓系白血病的外显子测序展开,提供了经过质控与重校准流程的样本数据,可用于白血病相关的基因组学研究。以下按不同方面对该数据集进行介绍。

【数据集背景】

急性髓系白血病是一种发生在髓系造血细胞的恶性疾病,其基因组变异研究对于理解发病机制、探索潜在标志物具有重要意义。该数据集属于肿瘤领域的 AML 研究数据,来源于 omicsdi.org,主题标签为 Genomics。其英文名称为 ena-DATASET-POL-28-08-2017-03:31:43:967-713 - samples。源站描述指出,该数据属于 2015 年全外显子测序的 AML 数据,比对到人类参考基因组 human_g1k_v37.fasta。这些信息表明,该数据集是围绕 2015 年 AML 全外显子测序工作形成的一组样本数据,服务于白血病基因组研究。

【数据内容】

该数据集为 2015 年全外显子测序的 AML 数据,比对到人类参考基因组 human_g1k_v37.fasta。源站描述提到,其中包含来自 Chunnam University 的 40 对 NR 样本。所有样本在比对到参考基因组的过程中,均已通过 QC 和重校准步骤。数据集英文名称中包含“samples”字样,说明其内容以样本形式组织。除上述信息外,关于样本的具体变异类型、覆盖深度、测序平台、文件格式等细节,源站未提供。

【采集与来源】

该数据集来源于 omicsdi.org。源站描述指出,数据属于 2015 年全外显子测序的 AML 数据,包含来自 Chunnam University 的 40 对 NR 样本。样本在比对到人类参考基因组 human_g1k_v37.fasta 时,已通过 QC 和重校准步骤。关于样本采集的具体时间、地点、伦理审批信息、患者临床特征等,源站未提供。

【适用场景】

基于该数据集为 2015 年全外显子测序的 AML 数据,并比对到人类参考基因组 human_g1k_v37.fasta,且包含来自 Chunnam University 的 40 对 NR 样本,其潜在适用场景包括急性髓系白血病相关的基因组学研究、全外显子测序数据的分析、以及围绕 AML 样本的变异探索等。由于所有样本已通过 QC 和重校准步骤,该数据可用于需要经过质控的外显子测序样本的研究场景。关于更具体的适用场景,如特定变异分析、临床关联研究等,源站未提供。

【使用方法】

该数据集为全外显子测序数据,比对到人类参考基因组 human_g1k_v37.fasta。使用时可基于该参考基因组进行序列比对结果的分析。源站描述提到所有样本已通过 QC 和重校准步骤,因此使用者可在此基础上开展后续分析。关于具体的下载方式、文件组织格式、分析流程、软件工具建议等,源站未提供。

【质量与限制】

源站描述指出,所有样本在比对到参考基因组的过程中均已通过 QC 和重校准步骤,说明数据在比对环节经过了质量控制。数据集包含来自 Chunnam University 的 40 对 NR 样本,属于 2015 年全外显子测序的 AML 数据。关于样本量是否满足特定研究需求、数据是否存在批次效应、覆盖度是否均一、以及其它可能影响分析的限制因素,源站未提供。

【引用与许可】

关于该数据集的引用方式、许可协议、使用条款等信息,源站未提供。

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数据集获取

源站:https://omicsdi.org/dataset/ega/EGAD00001003587

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

该数据属于2015年全外显子组测序的AML数据,已比对到人类参考基因组(human_g1k_v37.fasta)。其中包含来自全南大学的40对NR样本。所有样本在比对到参考基因组的过程中均已通过质控和重校准步骤。

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