ena-DATASET-POL-28-08-2017-03:31:43:967-713 - samples 数据集
该数据集来自 omicsdi.org,属于肿瘤领域的急性髓系白血病(AML)研究数据。数据为2015年全外显子测序的AML样本,比对到人类参考基因组 human_g1k_v37.fasta

基本信息
资源简介
ena-DATASET-POL-28-08-2017-03:31:43:967-713 - samples 数据集
该数据集来自 omicsdi.org,属于肿瘤领域的急性髓系白血病(AML)研究数据,主题标签为 Genomics。数据为 2015 年全外显子测序的 AML 样本,比对到人类参考基因组 human_g1k_v37.fasta。数据集英文名称为 ena-DATASET-POL-28-08-2017-03:31:43:967-713 - samples。整体来看,该数据集围绕急性髓系白血病的外显子测序展开,提供了经过质控与重校准流程的样本数据,可用于白血病相关的基因组学研究。以下按不同方面对该数据集进行介绍。
【数据集背景】
急性髓系白血病是一种发生在髓系造血细胞的恶性疾病,其基因组变异研究对于理解发病机制、探索潜在标志物具有重要意义。该数据集属于肿瘤领域的 AML 研究数据,来源于 omicsdi.org,主题标签为 Genomics。其英文名称为 ena-DATASET-POL-28-08-2017-03:31:43:967-713 - samples。源站描述指出,该数据属于 2015 年全外显子测序的 AML 数据,比对到人类参考基因组 human_g1k_v37.fasta。这些信息表明,该数据集是围绕 2015 年 AML 全外显子测序工作形成的一组样本数据,服务于白血病基因组研究。
【数据内容】
该数据集为 2015 年全外显子测序的 AML 数据,比对到人类参考基因组 human_g1k_v37.fasta。源站描述提到,其中包含来自 Chunnam University 的 40 对 NR 样本。所有样本在比对到参考基因组的过程中,均已通过 QC 和重校准步骤。数据集英文名称中包含“samples”字样,说明其内容以样本形式组织。除上述信息外,关于样本的具体变异类型、覆盖深度、测序平台、文件格式等细节,源站未提供。
【采集与来源】
该数据集来源于 omicsdi.org。源站描述指出,数据属于 2015 年全外显子测序的 AML 数据,包含来自 Chunnam University 的 40 对 NR 样本。样本在比对到人类参考基因组 human_g1k_v37.fasta 时,已通过 QC 和重校准步骤。关于样本采集的具体时间、地点、伦理审批信息、患者临床特征等,源站未提供。
【适用场景】
基于该数据集为 2015 年全外显子测序的 AML 数据,并比对到人类参考基因组 human_g1k_v37.fasta,且包含来自 Chunnam University 的 40 对 NR 样本,其潜在适用场景包括急性髓系白血病相关的基因组学研究、全外显子测序数据的分析、以及围绕 AML 样本的变异探索等。由于所有样本已通过 QC 和重校准步骤,该数据可用于需要经过质控的外显子测序样本的研究场景。关于更具体的适用场景,如特定变异分析、临床关联研究等,源站未提供。
【使用方法】
该数据集为全外显子测序数据,比对到人类参考基因组 human_g1k_v37.fasta。使用时可基于该参考基因组进行序列比对结果的分析。源站描述提到所有样本已通过 QC 和重校准步骤,因此使用者可在此基础上开展后续分析。关于具体的下载方式、文件组织格式、分析流程、软件工具建议等,源站未提供。
【质量与限制】
源站描述指出,所有样本在比对到参考基因组的过程中均已通过 QC 和重校准步骤,说明数据在比对环节经过了质量控制。数据集包含来自 Chunnam University 的 40 对 NR 样本,属于 2015 年全外显子测序的 AML 数据。关于样本量是否满足特定研究需求、数据是否存在批次效应、覆盖度是否均一、以及其它可能影响分析的限制因素,源站未提供。
【引用与许可】
关于该数据集的引用方式、许可协议、使用条款等信息,源站未提供。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://omicsdi.org/dataset/ega/EGAD00001003587
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
该数据属于2015年全外显子组测序的AML数据,已比对到人类参考基因组(human_g1k_v37.fasta)。其中包含来自全南大学的40对NR样本。所有样本在比对到参考基因组的过程中均已通过质控和重校准步骤。
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