9例AML患者LSC与原始细胞组分RNA测序数据集

该数据集来自omicsdi.org,包含对9例急性髓系白血病(AML)患者中27个经功能验证的LSC与原始细胞(blast)组分进行的RNA测序,同时纳入3个来自年龄匹配对照的健康造血干细胞与祖细胞样本

omicsdi
浏览 12
基因组分类Genomics
e7fd03c6-00fd-4b6a-bbe8-2d2dae132e62 - samples

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-08

资源简介

9例AML患者LSC与原始细胞组分RNA测序数据集

该数据集收录于omicsdi.org,主题标签为Genomics,本站分类归入肿瘤/急性髓系白血病方向。其核心内容是对9例急性髓系白血病(AML)患者中27个经功能验证的白血病干细胞(LSC)与原始细胞(blast)组分开展RNA测序,并同时纳入3个来自年龄匹配对照的健康造血干细胞与祖细胞样本。数据集英文名称为“e7fd03c6-00fd-4b6a-bbe8-2d2dae132e62 - samples”。整体而言,该资源围绕AML中LSC与blast组分的转录组特征展开,并以年龄匹配的健康造血干细胞与祖细胞作为对照,为理解AML细胞层级结构及相关分子差异提供RNA测序层面的数据基础。

【数据集背景】

急性髓系白血病是一种起源于造血系统的恶性疾病,白血病干细胞被认为是疾病起始、维持与复发的重要细胞群体。将LSC与原始细胞组分区分开来并比较其转录组特征,有助于刻画不同功能状态细胞之间的分子差异。该数据集正是在这一背景下产生,聚焦于经功能验证的LSC与blast组分,并设置年龄匹配的健康造血干细胞与祖细胞作为对照,以便在RNA测序层面观察AML相关细胞群体与正常造血干/祖细胞之间的转录组差异。数据集来源站为omicsdi.org,主题标签为Genomics,本站分类为肿瘤/急性髓系白血病。

【数据内容】

该数据集包含对9例AML患者中27个经功能验证的LSC与blast组分进行的RNA测序,同时包含3个来自年龄匹配对照的健康造血干细胞与祖细胞样本。样本类型覆盖AML患者的LSC与blast组分以及健康对照的造血干细胞与祖细胞。数据集英文名称为“e7fd03c6-00fd-4b6a-bbe8-2d2dae132e62 - samples”。除上述样本构成与测序类型外,源站未提供更多关于数据文件格式、数据量、测序平台、读长、表达矩阵或注释信息的细节。

【采集与来源】

该数据集来自omicsdi.org。样本来源包括9例急性髓系白血病患者以及年龄匹配的健康对照;其中患者样本为27个经功能验证的LSC与blast组分,对照样本为3个健康造血干细胞与祖细胞。关于样本采集的具体时间、地点、伦理审批、知情同意流程、患者治疗背景及对照匹配的具体标准,源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于围绕急性髓系白血病中LSC与blast组分转录组特征的分析场景,例如比较AML患者LSC与blast组分之间的基因表达差异,或将上述AML细胞群体与年龄匹配的健康造血干细胞与祖细胞进行转录组层面的对照分析。其主题标签为Genomics,本站分类为肿瘤/急性髓系白血病,因此也可用于与AML干细胞生物学、造血干/祖细胞相关转录组研究有关的探索性分析。关于具体分析流程、统计方法或验证实验,源站未提供。

【使用方法】

该数据集以RNA测序数据形式呈现,样本涵盖9例AML患者的27个经功能验证的LSC与blast组分,以及3个年龄匹配健康对照的造血干细胞与祖细胞。使用者可根据自身研究目的,对上述样本的RNA测序结果进行转录组比较分析。关于数据下载方式、文件组织、参考基因组版本、标准化流程及分析工具,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集包含9例AML患者与年龄匹配对照,样本数量有限;其中AML相关样本为27个经功能验证的LSC与blast组分,对照为3个健康造血干细胞与祖细胞。由于源站未提供测序深度、覆盖度、批次信息、质控指标及验证细节,无法进一步评估数据质量。该数据集仅覆盖RNA测序层面,不包含其他组学或临床结局信息。关于样本纳入排除标准、功能验证的具体方法及潜在混杂因素,源站未提供。

【引用与许可】

该数据集来源站为omicsdi.org,英文名称为“e7fd03c6-00fd-4b6a-bbe8-2d2dae132e62 - samples”。关于引用方式、原始文献、数据许可协议、使用限制及再分发条件,源站未提供。

官方服务

专家保障全链路合规授权与标注交付

陕川双基地 × 超十家三甲医院直连

从合规授权、采集治理、专业标注到数据集交付,我们提供全链路闭环服务,让高质量临床数据即拿即用。

⚡️ 需要原始数据或标注支持?联系我们获取定制方案。

帮我联系

下载信息

注册下载

需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。

暂未开放

公开下载

无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。

免登录

有偿下载

公开数据集受托下载与技术交付服务。

提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)

暂未开放

当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

使用方式

数据集获取

源站:https://omicsdi.org/dataset/ega/EGAD00001006112

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

对9名急性髓系白血病(AML)患者的27个经功能验证的白血病干细胞(LSC)和原始细胞组分进行了RNA测序。另对来自年龄匹配对照的3个健康造血干细胞和祖细胞进行了测序。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

数据缺失?

依托陕西、四川两大基地,我们与超过十家三甲医院建立直接合作关系,覆盖合规授权、采集治理、专业标注、数据交付的全流程,为AI医疗团队提供即拿即用的高质量临床数据。

⚡️ 需要数据支持或标注服务?立即联系我们获取专业方案。

获取专属数据定制方案