原代ALL细胞(B系)对长春新碱耐药性的转录组分析(MTT体外敏感性实验)

该数据集来自omicsdi.org,收录了通过MTT体外敏感性实验筛选出的对长春新碱耐药的原代急性淋巴细胞白血病(ALL)细胞(B系)的转录组表达谱

omicsdi
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基因组分类Transcriptomics
Transcription profiling of primary ALL cells (B-lineage) resistant to vincristine by the MTT in vitro sensitivity assay

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-19

资源简介

原代ALL细胞(B系)对长春新碱耐药性的转录组分析(MTT体外敏感性实验)

该数据集为转录组表达谱数据,英文名称为“Transcription profiling of primary ALL cells (B-lineage) resistant to vincristine by the MTT in vitro sensitivity assay”,在分类上归属于肿瘤领域下的急性淋巴细胞白血病方向,来源站为omicsdi.org。数据集收录的是通过MTT体外敏感性实验筛选出的、对长春新碱耐药的原代急性淋巴细胞白血病(B系)细胞的转录组表达谱,主题标签为Transcriptomics。整体而言,该数据集围绕原代ALL细胞对长春新碱的体外药物敏感性与基因表达谱之间的关联展开,为研究白血病细胞耐药相关转录特征提供了数据基础。

【数据集背景】

急性淋巴细胞白血病是血液系统常见的恶性肿瘤,按细胞来源可分为B系和T系等亚型。长春新碱是白血病化疗方案中的常用药物,肿瘤细胞对其产生耐药是影响治疗效果的重要问题。体外药物敏感性实验是评估细胞对化疗药物反应程度的常用手段,其中MTT法通过检测细胞代谢活性来反映细胞存活与药物敏感性。该数据集正是在这一研究背景下产生,聚焦于经MTT体外敏感性实验判定为对长春新碱耐药的原代ALL细胞,并以转录组表达谱的形式记录其基因表达状态,用于支撑耐药机制与表达特征方面的研究。

【数据内容】

数据集的内容为原代急性淋巴细胞白血病细胞的转录组表达谱,所涉及的细胞为B系来源,且经MTT体外敏感性实验筛选确定为对长春新碱耐药。主题标签为Transcriptomics,表明数据属于转录组学范畴。源站描述中提及primary ALL cells (B- and T-lineage) resistant to vincristine by the MTT in vitro sensitivity assay,而数据集名称与短描述均明确指向B系细胞。关于具体的样本数量、基因数量、表达值类型、数据文件格式等细节,源站未提供。

【采集与来源】

该数据集来源于omicsdi.org。其细胞材料为原代急性淋巴细胞白血病细胞,耐药表型通过MTT体外敏感性实验确定,即依据体外药物敏感性实验结果筛选出对长春新碱耐药的细胞群体,再对其进行转录组表达谱检测。关于样本采集的具体机构、患者来源信息、实验平台型号、测序或芯片技术细节、数据处理流程等,源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于与急性淋巴细胞白血病耐药相关的转录组学研究场景,例如分析对长春新碱耐药的原代B系ALL细胞的基因表达特征、探索耐药表型与转录谱之间的关联、作为相关研究中的表达谱参考数据,以及用于白血病药物耐药机制的探索性分析。由于数据聚焦于原代细胞而非细胞系,其表达谱可在一定程度上反映临床来源白血病细胞的转录状态。具体适用的分析类型需结合数据实际内容判断,源站未提供更多说明。

【使用方法】

使用者可依据数据集的转录组表达谱开展表达特征分析、差异表达比较或耐药相关通路与基因的探索。使用时应明确数据对应的是经MTT体外敏感性实验判定为对长春新碱耐药的原代B系ALL细胞,避免将其误用于其他亚型或其他药物的耐药分析。关于数据下载方式、文件组织格式、预处理步骤与标准化方法,源站未提供,使用前需自行确认数据的具体组织形式与适用范围。

【质量与限制】

该数据集基于原代ALL细胞与MTT体外敏感性实验,具有明确的耐药表型筛选依据。但源站未提供样本量、重复数、测序深度或芯片质控指标、数据完整性说明等信息,因此难以对数据质量作出具体评估。此外,源站描述中提及B系与T系细胞,而数据集名称与短描述聚焦于B系,使用者在解读样本构成时需注意这一表述差异。关于批次效应、临床信息完整性等方面的限制,源站未提供。

【引用与许可】

关于该数据集的引用方式、原始发表文献、许可协议与使用条款,源站未提供。使用者在引用或再利用该数据前,应自行向来源站omicsdi.org核实相关引用要求与许可条件。

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数据集获取

源站:https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-GEOD-649

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

primary ALL cells (B- and T-lineage) resistant to vincristine by the MTT in vitro sensitivity assay

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