人原代B系急性淋巴细胞白血病细胞对长春新碱敏感的转录谱
该数据集来自 omicsdi.org,为转录组学数据,聚焦人原代B系急性淋巴细胞白血病(ALL)细胞。源站描述表明样本为经MTT体外敏感性检测判定对长春新碱敏感的原代ALL细胞

基本信息
资源简介
人原代B系急性淋巴细胞白血病细胞对长春新碱敏感的转录谱
该数据集为转录组学(Transcriptomics)数据,聚焦人原代B系急性淋巴细胞白血病(ALL)细胞,其样本经MTT体外敏感性检测判定为对长春新碱敏感。数据集英文名称为“Transcription profiling of human primary ALL cells (B-lineage) sensitive to vincristine by the MTT in vitro sensitivity assay”,在分类上归属于肿瘤 / 急性淋巴细胞白血病方向,来源站为 omicsdi.org。从主题上看,该数据围绕转录组水平的表达谱展开,研究对象限定于B细胞谱系来源的原代ALL细胞,并以体外药物敏感性表型作为样本筛选依据。整体而言,该数据集将转录组学测量与细胞水平的长春新碱敏感性判定相结合,为在急性淋巴细胞白血病背景下考察与药物敏感性相关的基因表达特征提供了数据基础。
【数据集背景】
急性淋巴细胞白血病是血液系统常见的恶性肿瘤之一,其中B细胞谱系(B-lineage)是主要的免疫表型来源。在临床前与转化研究中,肿瘤细胞对化疗药物的体外敏感性是理解耐药机制、探索疗效相关分子标志的重要切入点。MTT体外敏感性检测通过代谢活性反映细胞存活与增殖状态,常被用于评估肿瘤细胞对特定药物的敏感程度。该数据集正是在这一研究背景下产生:以人原代B系ALL细胞为对象,先经MTT体外敏感性检测判定其对长春新碱的敏感性,再对相应样本进行转录组学表达谱分析,从而将药物敏感性表型与转录组特征联系起来。
【数据内容】
该数据集属于转录组学数据类型,核心内容是针对人原代B系急性淋巴细胞白血病细胞获得的转录表达谱。样本的界定特征是:来源于人原代B系ALL细胞,并且在MTT体外敏感性检测中表现为对长春新碱敏感。数据集英文名称中“Transcription profiling”表明其内容为转录水平的表达谱测量;“human primary ALL cells (B-lineage)”界定了物种与细胞来源;“sensitive to vincristine by the MTT in vitro sensitivity assay”则说明了样本筛选所依据的体外药物敏感性表型。关于具体的样本数量、检测平台、基因数量、表达矩阵格式等细节,源站未提供。
【采集与来源】
该数据集来源于 omicsdi.org。根据源站描述,其样本为经MTT体外敏感性检测判定对长春新碱敏感的原代B系ALL细胞。数据在分类上归入肿瘤 / 急性淋巴细胞白血病方向,主题标签为Transcriptomics。除上述来源与样本界定信息外,关于样本采集的具体临床来源、伦理审批信息、实验操作流程、测序或芯片平台型号等,源站未提供。
【适用场景】
基于其转录组学属性与明确的样本表型界定,该数据集可用于围绕B系急性淋巴细胞白血病细胞转录表达特征的分析工作,例如考察对长春新碱敏感的原代ALL细胞在转录组层面的表达模式,或将其作为药物敏感性相关表达特征研究的参考数据。由于样本以MTT体外敏感性检测结果作为筛选条件,该数据也适合用于将体外药物敏感性表型与转录组测量相联系的探索性研究。需要说明的是,上述适用方向基于数据类型的通用用途,具体分析目标是否适用仍需结合源站提供的完整信息判断;关于该数据集在特定研究中的验证结论,源站未提供。
【使用方法】
该数据集为转录组学表达谱数据,通常可按表达谱数据的通用方式使用,例如进行表达特征描述、样本间比较或与药物敏感性表型关联的探索性分析。关于数据的具体文件格式、下载方式、预处理流程、标准化方法以及配套的分析说明,源站未提供,使用前需依据源站的实际数据组织方式确认。
【质量与限制】
该数据集的样本界定明确,限定于人原代B系ALL细胞且经MTT体外敏感性检测判定对长春新碱敏感,这使其在表型定义上具有较好的针对性。但需注意,其样本范围集中于“对长春新碱敏感”这一表型,未涵盖耐药或不敏感样本的信息,源站亦未提供样本量、平台信息与质控指标,因此数据的代表性、批次效应与可重复性等方面的情况无法从现有信息判断。相关质量评估与局限性说明,源站未提供。
【引用与许可】
关于该数据集的引用方式、原始文献、作者信息以及使用许可条款,源站未提供。使用者在引用或再利用该数据前,应前往 omicsdi.org 对应条目核实相关要求。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
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公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-GEOD-657
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
primary ALL cells (B-lineage) sensitive to vincristine by the MTT in vitro sensitivity assay
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