人原代B系急性淋巴细胞白血病细胞对L-asparaginase敏感性的转录组分析
该数据集来自omicsdi.org,收录人原代B系急性淋巴细胞白血病(ALL)细胞的转录组表达谱,这些细胞经MTT体外敏感性检测判定为对L-asparaginase敏感

基本信息
资源简介
人原代B系急性淋巴细胞白血病细胞对L-asparaginase敏感性的转录组分析
该数据集为一份人源转录组表达谱数据,英文全称为 Transcription profiling of human primary ALL cells (B-lineage) sensitive to L-asparaginase by the MTT in vitro sensitivity assay,归属于肿瘤领域中急性淋巴细胞白血病方向,由 omicsdi.org 收录。数据集聚焦于人原代 B 系急性淋巴细胞白血病(ALL)细胞,这些细胞经 MTT 体外敏感性检测被判定为对 L-asparaginase(左旋门冬酰胺酶)敏感,并在此基础上开展了转录组水平的表达谱测定。主题标签为 Transcriptomics,表明其核心数据形式为转录组学测量结果。该数据集可用于考察对 L-asparaginase 敏感的人原代 B 系 ALL 细胞在基因表达层面的特征,为相关研究提供表达谱层面的参考信息。
【数据集背景】
急性淋巴细胞白血病是血液系统常见的恶性疾病,其中 B 系来源的病例在临床与研究工作中受到广泛关注。L-asparaginase 是 ALL 治疗中常用的药物之一,不同患者来源的白血病细胞对该药物的体外敏感性存在差异。该数据集正是围绕“对 L-asparaginase 敏感”这一表型特征,选取人原代 B 系 ALL 细胞进行转录组表达谱分析,从而将体外药物敏感性检测结果与基因表达信息联系起来。数据集的英文名称明确点出了 MTT 体外敏感性检测这一实验判定方式,说明样本的“敏感”属性来自体外细胞水平的检测,而非临床用药反应的推断。
【数据内容】
数据集的内容为转录组表达谱,即对上述人原代 B 系 ALL 细胞样本进行转录组水平的测量所得的表达数据。主题标签为 Transcriptomics,与数据集名称中的“Transcription profiling”相呼应。样本类型为人原代细胞,且限定为 B 系急性淋巴细胞白血病细胞,并经过 MTT 体外敏感性检测筛选为对 L-asparaginase 敏感。除上述信息外,表达谱的具体基因数量、样本数量、测序平台或芯片平台、表达量数值范围等细节,源站未提供。
【采集与来源】
该数据集来源于 omicsdi.org。样本的生物学来源为人原代 B 系急性淋巴细胞白血病细胞;样本对 L-asparaginase 的敏感性通过 MTT 体外敏感性检测确定。关于样本采集的具体机构、患者数量、伦理审批信息、实验操作流程以及数据产生的时间与版本信息,源站未提供。
【适用场景】
基于现有信息,该数据集适用于与 B 系急性淋巴细胞白血病相关的转录组学研究场景,尤其是关注 L-asparaginase 体外敏感性的表达谱分析。研究人员可将其作为对 L-asparaginase 敏感的人原代 B 系 ALL 细胞的表达谱参考,用于探索敏感性相关的基因表达特征,或与其他 ALL 转录组数据进行比较研究。需要说明的是,该数据集仅覆盖“敏感”这一表型,不包含耐药或对照样本的信息,因此不宜直接用于敏感与耐药之间的差异比较;关于其在药物机制研究、生物标志物发现等方面的具体适用性,源站未提供。
【使用方法】
该数据集以转录组表达谱的形式提供,使用者可按转录组数据的常规分析流程进行检索、下载与处理。关于数据的具体文件格式、下载地址、访问方式、是否提供预处理后的表达矩阵或原始数据、以及配套的样本注释信息,源站未提供。使用前建议先确认数据组织方式与样本标识,再结合研究目的开展表达谱层面的分析。
【质量与限制】
该数据集样本限定为人原代 B 系 ALL 细胞,且仅纳入经 MTT 体外敏感性检测判定为对 L-asparaginase 敏感的样本,样本范围较为集中,便于聚焦特定表型,但也意味着缺乏表型对照,限制了组间比较类分析。关于数据质量评估指标、样本量、重复次数、批次效应处理情况以及数据完整性等信息,源站未提供。此外,体外 MTT 敏感性检测结果与临床药物反应之间的关系,源站未提供相关说明,使用时应谨慎解读。
【引用与许可】
关于该数据集的引用方式、原始发表文献、数据许可协议以及使用条款,源站未提供。使用者在引用或再利用该数据集前,应自行向来源站 omicsdi.org 核实相关引用要求与许可条件。
下载信息
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使用方式
数据集获取
源站:https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-GEOD-653
标准获取流程:
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- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
primary ALL cells (B-lineage) sensitive to L-asparaginase by the MTT in vitro sensitivity assay
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