人原代B系急性淋巴细胞白血病细胞对柔红霉素敏感性的转录组分析

该数据集来自omicsdi.org,收录人原代B系急性淋巴细胞白血病(ALL)细胞的转录组表达谱数据,样本依据MTT体外敏感性检测结果被界定为对柔红霉素敏感

omicsdi
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基因组分类Transcriptomics
Transcription profiling of human primary ALL cells (B-lineage) sensitive to daunorubicin by the MTT in vitro sensitivity assay

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-19

资源简介

人原代B系急性淋巴细胞白血病细胞对柔红霉素敏感性的转录组分析

该数据集为一份人源转录组表达谱资源,英文全称为 Transcription profiling of human primary ALL cells (B-lineage) sensitive to daunorubicin by the MTT in vitro sensitivity assay,在站内归入肿瘤 / 急性淋巴细胞白血病分类,来源站为 omicsdi.org。数据集聚焦人原代B系急性淋巴细胞白血病(ALL)细胞,样本依据MTT体外敏感性检测结果被界定为对柔红霉素敏感,并以转录组学(Transcriptomics)作为主题标签。整体而言,该资源围绕药物敏感性表型与基因表达谱之间的对应关系组织数据,适合关注白血病细胞药物反应机制、转录组层面差异表达分析以及体外药敏表型关联研究的使用者参考。以下从背景、内容、来源、适用场景、使用方法、质量与限制、引用与许可等方面作进一步说明。

【数据集背景】

急性淋巴细胞白血病是血液系统常见的恶性疾病,其中B系(B-lineage)起源的病例在临床与基础研究中均占有重要位置。柔红霉素是蒽环类抗肿瘤药物,在白血病治疗中具有明确地位,不同患者原代细胞对其体外敏感性存在差异。该数据集以人原代B系ALL细胞为对象,通过MTT体外敏感性检测区分出对柔红霉素敏感的样本,并对其转录组进行表达谱分析,从而为研究药物敏感性的分子基础提供数据支撑。数据集的主题标签为转录组学,说明其核心数据形态是基因表达层面的测量结果,而非基因组变异或蛋白层面信息。

【数据内容】

数据集收录的是人原代B系急性淋巴细胞白血病细胞的转录组表达谱数据。样本的界定依据是MTT体外敏感性检测结果,即被判定为对柔红霉素敏感的细胞群体。数据内容围绕转录组表达谱展开,主题标签明确指向 Transcriptomics。除上述表达谱与敏感性表型界定外,数据集是否包含其他类型的组学测量、临床注释字段或样本元数据,源站未提供。

【采集与来源】

该数据集来源于 omicsdi.org,源站对其的描述为“primary ALL cells (B-lineage) sensitive to daunorubicin by the MTT in vitro sensitivity assay”,与数据集英文名称所表达的内容一致。样本材料为人原代B系ALL细胞,敏感性判定方法为MTT体外敏感性检测。关于样本采集的具体机构、患者来源、伦理审批信息以及数据产生所用的具体平台与流程,源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于以转录组表达谱为切入点的白血病药物敏感性研究。典型用途包括:分析对柔红霉素敏感的原代B系ALL细胞在基因表达层面的特征;将表达谱与MTT体外药敏表型进行关联,探索潜在的敏感性相关表达模式;作为原代白血病细胞转录组研究的参考数据,用于方法学比较或与其他ALL表达谱资源的对照分析。由于样本限定为对柔红霉素敏感的原代B系ALL细胞,该数据更适合围绕敏感性表型开展分析,而不宜直接外推至耐药样本或非B系白血病。

【使用方法】

使用者可依据转录组表达谱数据开展差异表达、通路富集或表达模式聚类等常规分析,并结合样本的MTT体外敏感性判定结果进行表型—表达关联研究。在分析设计中,应注意样本表型已被限定为对柔红霉素敏感,因此比较分析需谨慎设置参照。关于数据的具体文件格式、下载方式、预处理程度与标准化流程,源站未提供,使用前需自行确认数据组织方式与适用范围。

【质量与限制】

该数据集的核心限定在于样本表型单一,即仅涵盖经MTT检测判定为对柔红霉素敏感的原代B系ALL细胞,缺少耐药或对照样本的说明,源站未提供相关对照信息。样本量、重复数、批次信息、数据质控指标以及表达谱的定量方法等均未在源站描述中体现。因此,使用者在解读结果时应考虑样本代表性与表型界定的局限,避免将基于敏感样本的结论过度推广。此外,MTT体外敏感性检测反映的是体外条件下的细胞反应,与临床用药反应之间的关系需另行验证。

【引用与许可】

该数据集来源于 omicsdi.org,关于数据集的引用方式、原始发表文献、许可协议与使用条款,源站未提供。使用者在引用或再分发数据前,应访问来源站核实相关要求。

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使用方式

数据集获取

源站:https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-GEOD-659

标准获取流程:

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  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
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数据说明

primary ALL cells (B-lineage) sensitive to daunorubicin by the MTT in vitro sensitivity assay

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