人原代B系急性淋巴细胞白血病细胞对L-天冬酰胺酶耐药性的转录组分析
该数据集来源于omicsdi.org,收录了通过MTT体外敏感性检测筛选出的人原代B系急性淋巴细胞白血病(ALL)细胞对L-天冬酰胺酶耐药性的转录组分析数据

基本信息
资源简介
人原代B系急性淋巴细胞白血病细胞对L-天冬酰胺酶耐药性的转录组分析
该数据集为转录组分析数据,英文名称为“Transcription profiling of human primary ALL cells (B-lineage) resistant to L-asparaginase by the MTT in vitro sensitivity assay”,在来源站点归类于肿瘤 / 急性淋巴细胞白血病方向,主题标签为 Transcriptomics。数据集聚焦于通过 MTT 体外敏感性检测筛选出的人原代 B 系急性淋巴细胞白血病(ALL)细胞对 L-天冬酰胺酶耐药性的转录组分析,来源于 omicsdi.org。整体而言,该数据集围绕白血病细胞药物敏感性表型与转录组特征之间的关联展开,适合关注急性淋巴细胞白血病耐药机制、转录组学分析以及体外药敏检测相关研究的人员参考使用。
【数据集背景】
急性淋巴细胞白血病是血液系统常见的恶性肿瘤之一,其中 B 系来源的病例在临床中占有重要比例。L-天冬酰胺酶是 ALL 治疗中常用的药物之一,肿瘤细胞对该药物产生耐药性往往会影响治疗效果。该数据集正是围绕人原代 B 系 ALL 细胞对 L-天冬酰胺酶的耐药性展开,通过 MTT 体外敏感性检测获得细胞的药物敏感性表型,并在此基础上进行转录组分析,为研究耐药相关转录特征提供数据基础。数据集在来源站点被归入肿瘤 / 急性淋巴细胞白血病分类,主题标签为 Transcriptomics,体现了其以转录组学为核心的研究视角。
【数据内容】
该数据集的核心内容是人原代 B 系 ALL 细胞在经 MTT 体外敏感性检测判定为对 L-天冬酰胺酶耐药后的转录组分析数据。源站描述明确指出其对象为“primary ALL cells (B-lineage) resistant to L-asparaginase by the MTT in vitro sensitivity assay”,即通过 MTT 体外敏感性检测筛选出的耐药原代 B 系 ALL 细胞。数据主题标签为 Transcriptomics,说明数据主体为转录组层面的测量结果。关于具体样本数量、转录组检测平台、基因表达矩阵的规模、分组设计细节以及是否包含对照样本等信息,源站未提供。
【采集与来源】
该数据集来源于 omicsdi.org。根据源站描述,样本材料为人原代 B 系 ALL 细胞,耐药性判定依据为 MTT 体外敏感性检测。MTT 法是一种常用的体外细胞活力与药物敏感性检测方法,通过代谢活性反映细胞对药物的反应,从而区分耐药与敏感细胞。数据集所涉及的转录组分析即建立在这一体外药敏表型筛选基础之上。关于样本采集的具体临床来源、患者数量、伦理审批信息、细胞培养条件以及转录组检测的具体实验流程,源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于与急性淋巴细胞白血病耐药研究相关的转录组学分析场景,例如比较耐药细胞与敏感细胞之间的转录组差异、探索与 L-天冬酰胺酶耐药相关的基因表达特征、开展白血病细胞药物敏感性表型与转录组数据的整合分析等。由于数据聚焦于人原代 B 系 ALL 细胞,对于关注原代细胞而非细胞系的研究者具有一定参考价值。此外,该数据集也可作为肿瘤 / 急性淋巴细胞白血病方向转录组数据的补充资源,用于方法学验证或探索性分析。关于数据是否适用于临床转化研究或特定分析流程,源站未提供相关说明。
【使用方法】
该数据集可通过来源站点 omicsdi.org 获取,使用者可依据该站点提供的数据访问方式进行下载或检索。在使用时,建议结合数据集主题标签 Transcriptomics 以及源站描述中关于 MTT 体外敏感性检测与 L-天冬酰胺酶耐药性的说明,理解数据的生物学背景。由于源站未提供具体的文件格式、数据结构、预处理步骤和分析流程说明,使用者在开展差异表达分析、富集分析或其他转录组分析前,应自行确认数据组织方式与质量控制情况。关于是否需要额外注释文件、参考基因组版本以及分析软件建议,源站未提供。
【质量与限制】
该数据集基于 MTT 体外敏感性检测判定耐药性,并在此基础上开展转录组分析,其数据价值与药敏表型判定的可靠性密切相关。MTT 法作为体外检测手段,其结果受实验条件影响,但源站未提供具体的质量控制指标、重复次数或验证实验信息。此外,源站未提供样本量、临床背景信息、转录组数据的技术参数以及数据完整性说明,使用者在解读结果时需注意这些信息的缺失可能带来的限制。该数据集仅覆盖人原代 B 系 ALL 细胞对 L-天冬酰胺酶的耐药性转录组分析,不宜外推至其他白血病亚型或其他药物。关于数据的批次效应、缺失值处理及标准化方法,源站未提供。
【引用与许可】
关于该数据集的引用方式、原始文献出处、作者信息以及数据使用许可条款,源站未提供。使用者在引用或再利用该数据集时,应前往 omicsdi.org 查看该数据集条目对应的来源信息与使用条款,并遵循来源站点的相关要求。
下载信息
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无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
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提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
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使用方式
数据集获取
源站:https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-GEOD-654
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
primary ALL cells (B-lineage) resistant to L-asparaginase by the MTT in vitro sensitivity assay
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