人原代急性淋巴细胞白血病细胞对长春新碱敏感性的转录组分析

该数据集来自 omicsdi.org,收录人原代急性淋巴细胞白血病(ALL)细胞的转录组表达谱,样本涵盖 B 细胞系与 T 细胞系,并依据 MTT 体外敏感性检测结果标注其对长春新碱的敏感性

omicsdi
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基因组分类Transcriptomics
Transcription profiling of human primary ALL cells (B- and T-lineage) sensitive to vincristine by the MTT in vitro sensitivity assay

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-19

资源简介

人原代急性淋巴细胞白血病细胞对长春新碱敏感性的转录组分析

该数据集为一份人原代急性淋巴细胞白血病(ALL)细胞的转录组表达谱资源,样本覆盖 B 细胞系与 T 细胞系两类来源,并依据 MTT 体外敏感性检测的结果,对细胞样本针对长春新碱的敏感性进行了标注。数据集以转录组学(Transcriptomics)为主题标签,归属于肿瘤 / 急性淋巴细胞白血病分类,来源于 omicsdi.org。其核心价值在于将原代白血病细胞的基因表达信息与体外药物敏感性表型相对应,为研究 ALL 细胞对长春新碱敏感性的分子基础提供了可用的数据基础。以下从背景、内容、来源、适用场景、使用方法、质量与限制以及引用与许可等方面进行介绍。

【数据集背景】

急性淋巴细胞白血病是来源于淋巴系祖细胞的恶性血液肿瘤,按细胞来源可分为 B 细胞系与 T 细胞系等亚型。长春新碱是 ALL 治疗中常用的化疗药物之一,不同患者来源的白血病细胞对其敏感性存在差异,而这种差异背后的分子机制是转化研究与临床用药探索关注的问题。该数据集以人原代 ALL 细胞为研究对象,将转录组表达谱与 MTT 体外敏感性检测所得的药物敏感性信息结合,为在转录水平上考察长春新碱敏感性差异提供了数据支撑。

【数据内容】

数据集收录的是人原代急性淋巴细胞白血病细胞的转录组表达谱,样本涵盖 B 细胞系与 T 细胞系。每个样本除表达谱信息外,还带有依据 MTT 体外敏感性检测结果确定的长春新碱敏感性标注。主题标签为 Transcriptomics,表明数据主体为转录组层面的表达测量结果。关于具体的样本数量、基因数量、测序平台或芯片平台、表达值类型等细节,源站未提供。

【采集与来源】

该数据集来源于 omicsdi.org,源站对其的描述为:经 MTT 体外敏感性检测判定对长春新碱敏感的人原代 ALL 细胞(B 细胞系与 T 细胞系)。数据以人原代白血病细胞为材料,敏感性表型通过 MTT 体外敏感性检测获得。关于样本采集机构、患者临床信息、伦理审批信息以及原始数据产生实验室等,源站未提供。

【适用场景】

该数据集可用于研究 ALL 原代细胞中基因表达与长春新碱体外敏感性之间的关联,例如筛选与敏感性相关的表达特征、比较 B 细胞系与 T 细胞系样本在表达层面的差异,或作为药物敏感性预测方法开发与验证的参考数据。由于样本为原代白血病细胞而非细胞系,其表达谱更接近患者来源细胞的真实状态,适合用于转化导向的表达—药敏关联分析。关于该数据集是否已被用于特定研究或是否适合某类具体分析流程,源站未提供。

【使用方法】

使用时可依据样本的长春新碱敏感性标注将样本分组,结合转录组表达谱开展差异表达分析、相关性分析或分类建模等。分析中需注意区分 B 细胞系与 T 细胞系样本,避免谱系构成差异对结果造成混杂。关于数据文件格式、下载方式、预处理步骤与标准化方法,源站未提供,使用前应向数据提供方确认。

【质量与限制】

该数据集基于原代 ALL 细胞,样本涵盖 B 与 T 两个谱系,并配有 MTT 体外敏感性表型,这是其主要优势。但需注意,MTT 体外敏感性检测反映的是体外条件下的药物反应,与临床疗效之间不能直接等同;原代细胞样本的谱系构成与个体差异也可能影响表达谱的可比性。关于样本量、数据完整性、批次效应控制与质控指标等,源站未提供,使用者应自行评估数据适用性。

【引用与许可】

关于该数据集的引用方式、原始发表文献、数据许可协议与使用限制,源站未提供。使用与再分发前应向数据提供方或源站确认相关要求。

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使用方式

数据集获取

源站:https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-GEOD-648

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

primary ALL cells (B- and T-lineage) sensitive to vincristine by the MTT in vitro sensitivity assay

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