人原代急性淋巴细胞白血病细胞(B系和T系)对泼尼松龙敏感的转录组分析
该数据集来自 omicsdi.org,收录人原代急性淋巴细胞白血病(ALL)细胞(B系和T系)的转录组分析数据,样本经 MTT 体外敏感性检测判定为对泼尼松龙敏感

基本信息
资源简介
人原代急性淋巴细胞白血病细胞(B系和T系)对泼尼松龙敏感的转录组分析
该数据集为英文命名的转录组分析数据,聚焦人原代急性淋巴细胞白血病(ALL)细胞,涵盖B系与T系两个谱系,样本经MTT体外敏感性检测判定为对泼尼松龙敏感。数据集在分类上归属于肿瘤领域下的急性淋巴细胞白血病方向,主题标签为转录组学(Transcriptomics),来源站为omicsdi.org。其核心价值在于将药物敏感性表型与转录组表达谱相对应,为研究ALL细胞对糖皮质激素类药物的敏感机制提供数据基础。整体而言,该数据集围绕“泼尼松龙敏感的人原代ALL细胞”这一明确限定条件组织样本与检测,适合用于白血病转录组层面的探索性分析。
【数据集背景】
急性淋巴细胞白血病是来源于淋巴系祖细胞的恶性血液肿瘤,按细胞谱系可分为B系与T系两大类。糖皮质激素(如泼尼松龙)是ALL治疗方案中的重要组成药物,不同患者来源的白血病细胞对这类药物的敏感性存在差异。该数据集正是针对这一背景,选取经MTT体外敏感性检测判定为对泼尼松龙敏感的人原代ALL细胞,开展转录组水平的表达谱分析,以期从基因表达层面刻画敏感细胞的分子特征。数据集同时覆盖B系与T系两个谱系,便于在统一实验框架下比较不同谱系来源细胞的转录组表现。
【数据内容】
数据集的内容主体为人原代ALL细胞的转录组分析数据,样本涵盖B系和T系两个谱系,且均经过MTT体外敏感性检测筛选,确认为对泼尼松龙敏感。主题标签为转录组学,表明数据以基因表达层面的测量为核心。关于具体的样本数量、测序平台、表达矩阵规模、基因注释版本等细节,源站未提供。
【采集与来源】
该数据集来源于omicsdi.org。样本类型为人原代ALL细胞,即直接取自患者的白血病细胞,而非体外建系的细胞株;谱系覆盖B系与T系。样本对泼尼松龙的敏感性判定依据为MTT体外敏感性检测。关于样本采集的具体机构、患者临床信息、伦理审批信息以及数据产生的时间与实验地点,源站未提供。
【适用场景】
基于其内容限定,该数据集可适用于以下方向:研究泼尼松龙敏感的人原代ALL细胞在转录组层面的表达特征;在B系与T系ALL之间开展转录组比较分析;将药物敏感性表型与基因表达谱关联,探索与糖皮质激素敏感性相关的候选基因或通路;作为白血病转录组研究的参考数据,与其他ALL表达数据集进行对照或整合分析。需要说明的是,由于数据集仅纳入敏感样本,不包含耐药对照,因此不适合单独用于敏感与耐药的直接差异比较。关于数据是否适用于临床决策或药物开发,源站未提供相关说明。
【使用方法】
使用者可依据来源站omicsdi.org获取该数据集。由于源站未提供具体的文件格式、数据组织方式与访问协议,实际下载与解析方式需以来源站页面说明为准。在分析层面,建议结合样本的谱系归属(B系或T系)与敏感性表型标签进行分组解读,并注意转录组数据常规的预处理与标准化流程。关于是否提供预处理后的表达矩阵或原始数据,源站未提供。
【质量与限制】
该数据集的关键限定在于样本均经MTT体外敏感性检测判定为对泼尼松龙敏感,且仅涉及人原代ALL细胞的B系与T系,样本范围相对集中。这一设计使其在特定问题上具有针对性,但也意味着缺乏耐药样本对照,限制了敏感性相关结论的对比强度。此外,关于样本量、重复数、测序深度、数据质控指标以及批次效应等信息,源站未提供,使用者在解读结果时需自行评估数据充分性。
【引用与许可】
关于该数据集的引用方式、文献出处、许可条款与使用限制,源站未提供。使用者在引用或再利用前,应查阅来源站omicsdi.org上的相应说明。
下载信息
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需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
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公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-GEOD-646
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
primary ALL cells (B- and T-lineage) sensitive to prednisolone by the MTT in vitro sensitivity assay
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