人原代急性淋巴细胞白血病细胞对柔红霉素耐药性的转录组分析
该数据集来自 omicsdi.org,收录人原代急性淋巴细胞白血病(ALL)细胞(B 系和 T 系)的转录组表达谱,这些细胞经 MTT 体外敏感性实验判定为对柔红霉素耐药

基本信息
资源简介
人原代急性淋巴细胞白血病细胞对柔红霉素耐药性的转录组分析
该数据集收录人原代急性淋巴细胞白血病(ALL)细胞的转录组表达谱,涵盖B系和T系两个谱系。这些原代细胞经MTT体外敏感性实验判定为对柔红霉素耐药,因而构成一组以药物耐药表型为特征的转录组研究材料。数据集英文名称为“Transcription profiling of human primary ALL cells (B- and T-lineage) resistant to daunorubicin by the MTT in vitro sensitivity assay”,在分类上归属于肿瘤领域的急性淋巴细胞白血病方向,主题标签为转录组学(Transcriptomics),来源站为omicsdi.org。整体而言,该数据集围绕柔红霉素耐药这一关键临床问题,提供了原代白血病细胞的基因表达层面观察材料,可供研究者在转录组水平上考察B系与T系ALL细胞耐药表型的分子特征。
【数据集背景】
急性淋巴细胞白血病是来源于淋巴系前体细胞的恶性血液肿瘤,按细胞谱系可分为B系和T系。柔红霉素是ALL治疗中常用的蒽环类化疗药物,耐药的发生直接影响治疗反应。该数据集正是针对这一背景,选取经MTT体外敏感性实验判定为对柔红霉素耐药的人原代ALL细胞(包括B系和T系),开展转录组表达谱分析,以刻画耐药细胞的基因表达状态。
【数据内容】
数据集的核心内容是上述原代ALL细胞的转录组表达谱,即基因表达层面的测量结果。样本覆盖B系和T系两个ALL谱系,且均具有经MTT体外敏感性实验确认的柔红霉素耐药表型。数据主题归类为转录组学。除上述范围与主题外,源站未提供关于基因数量、样本数量、表达定量单位或具体分析结果等更细化的信息。
【采集与来源】
数据来源于omicsdi.org。样本材料为人原代ALL细胞,包括B系和T系;耐药表型的判定依据为MTT体外敏感性实验。源站描述与数据集名称一致,均指向“经MTT体外敏感性实验判定对柔红霉素耐药的原代ALL细胞(B系和T系)”的转录组分析。关于样本采集机构、患者来源、伦理审批及实验平台等具体信息,源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于与急性淋巴细胞白血病耐药相关的转录组研究场景,例如比较B系与T系ALL耐药细胞的表达特征、探索柔红霉素耐药表型在转录组层面的表现、作为原代白血病细胞耐药研究的参考表达数据等。其价值在于将明确的体外药物敏感性表型与转录组测量相结合,便于在基因表达层面开展耐药机制的探索性分析。具体应用方向需结合研究者自身设计,源站未提供推荐用途。
【使用方法】
使用者可依据数据集名称与主题标签定位该转录组表达谱资源,并通过来源站omicsdi.org获取。使用时应关注样本的谱系归属(B系或T系)以及耐药表型的判定方式(MTT体外敏感性实验),在分析中将表型信息与表达谱对应起来。关于数据下载格式、预处理流程、标准化方法及配套分析工具,源站未提供。
【质量与限制】
该数据集的表型判定基于MTT体外敏感性实验,样本为原代ALL细胞,涵盖B系与T系,这些构成了数据解释的基本前提。需要说明的是,源站未提供样本量、重复数、测序或芯片平台、数据质控指标等信息,因此无法对数据质量作进一步评估;同时,源站也未提供临床背景、治疗史等协变量信息,使用者在推断时需注意这些限制。
【引用与许可】
关于该数据集的引用方式、原始文献、作者信息以及使用许可条款,源站未提供。使用者在引用或再利用前,应自行向来源站omicsdi.org核实相关要求。
下载信息
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暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
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使用方式
数据集获取
源站:https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-GEOD-651
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
primary ALL cells (B- and T-lineage) resistant to daunorubicin by the MTT in vitro sensitivity assay
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