phs000637:Methotrexate 清除率 GWAS
该数据集为 dbGaP 收录的队列研究,英文名 phs000637: Methotrexate Clearance GWAS,本站归类于肿瘤 / 急性淋巴细胞白血病

基本信息
资源简介
phs000637:Methotrexate 清除率 GWAS
phs000637: Methotrexate Clearance GWAS 是收录于美国国家生物技术信息中心(NCBI)旗下 dbGaP 数据库的一项队列研究数据集,其英文全称为 phs000637: Methotrexate Clearance GWAS。该数据集在本站被归类于肿瘤 / 急性淋巴细胞白血病方向,主题标签为队列(Cohort)。从名称来看,该研究聚焦于甲氨蝶呤(Methotrexate)清除率的全基因组关联分析(GWAS),甲氨蝶呤是急性淋巴细胞白血病治疗中常用的化疗药物之一,其体内清除情况可能影响药物疗效与毒性反应。该数据集以队列研究形式组织,来源于 dbGaP 这一权威的基因型与表型数据库,为相关领域的研究者提供了可探索的数据资源。
【数据集背景】
该数据集来源于 dbGaP,即 NCBI 维护的基因型与表型数据库。dbGaP 专门收录大规模基因组学研究产生的数据,包括全基因组关联研究、临床表型信息以及相关样本信息。phs000637 这一编号表明它是 dbGaP 中注册的一项独立研究。研究主题为甲氨蝶呤清除率的全基因组关联分析,结合本站将其归类于肿瘤 / 急性淋巴细胞白血病,可以判断该研究关注的是急性淋巴细胞白血病患者在接受甲氨蝶呤治疗时,药物清除能力的遗传影响因素。急性淋巴细胞白血病是儿童和成人中常见的血液系统恶性肿瘤,甲氨蝶呤作为核心化疗药物之一,其药代动力学个体差异较大,寻找与之相关的遗传变异具有临床意义。该数据集以队列研究形式呈现,意味着它可能包含一组具有共同特征的研究对象,并在一定时间内进行了随访或观察。
【数据内容】
该数据集的具体数据内容,如样本量、基因分型平台、表型字段、清除率测量方式等,源站未提供。根据其名称和分类,可以合理推断其涉及甲氨蝶呤清除率相关的表型数据以及全基因组关联分析所需的基因型数据,但具体变量、数据文件格式、数据字典等信息均未在现有资料中说明。主题标签“Cohort”提示该数据集以队列形式组织,可能包含纵向随访信息,但具体随访时间、随访指标等细节源站未提供。
【采集与来源】
该数据集来源于 ncbi.nlm.nih.gov,即美国国家生物技术信息中心。dbGaP 作为其下属数据库,负责收集、整理和分发由各类研究项目产生的基因组与表型数据。源站描述仅标明“dbGaP study (Cohort)”,说明该研究在 dbGaP 中被登记为一项队列研究。关于具体的采集机构、研究负责人、招募地点、招募时间、样本采集流程、伦理审批信息等,源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于与急性淋巴细胞白血病治疗相关的药物基因组学研究,尤其是甲氨蝶呤清除率的遗传关联分析。研究者可以利用该数据集探索影响甲氨蝶呤清除的遗传变异,进而理解药物反应个体差异的生物学基础。此外,该数据集也可用于方法学比较、重复验证已有发现或作为荟萃分析的组成部分。由于其为队列研究,可能还适用于纵向分析或生存分析等场景,但具体适用性取决于数据实际包含的变量,而变量细节源站未提供。
【使用方法】
该数据集的具体使用方法,包括如何申请访问、下载方式、数据格式、分析工具要求等,源站未提供。通常 dbGaP 数据需要经过数据访问申请并获得授权后才能获取受控数据,但该数据集的具体访问流程和限制条件源站未提供。
【质量与限制】
该数据集的质量控制信息、样本排除标准、基因型质控指标、群体分层校正方法等,源站未提供。其限制可能包括样本量有限、特定人群代表性不足、甲氨蝶呤清除率测量方法差异等,但具体限制内容源站未提供。
【引用与许可】
该数据集的引用方式、许可协议、使用条款、数据共享政策等,源站未提供。使用者应参考 dbGaP 官方页面获取最新的引用要求和许可信息。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/projects/gap/cgi-bin/study.cgi?study_id=phs000637
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
dbGaP study (Cohort).
数据缺失?
依托陕西、四川两大基地,我们与超过十家三甲医院建立直接合作关系,覆盖合规授权、采集治理、专业标注、数据交付的全流程,为AI医疗团队提供即拿即用的高质量临床数据。
⚡️ 需要数据支持或标注服务?立即联系我们获取专业方案。




