RNA聚合酶II相关因子1调控暂停的RNA聚合酶II释放与磷酸化

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE62171

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

在早期延伸过程中，启动子近端暂停的RNA聚合酶II（Pol II）的释放是后生动物细胞转录调控的关键步骤。暂停Pol II的释放被认为需要细胞周期蛋白依赖性激酶9（CDK9）的激酶活性，以磷酸化DRB敏感性诱导因子、负延伸因子以及Pol II的C端结构域（CTD）丝氨酸-2。我们发现，Pol II相关因子1（PAF1）是暂停Pol II释放的关键调控因子；正转录延伸因子b（P-TEFb）直接调控PAF1复合物（PAF1C）向基因的初始招募；而随后CDK12的招募依赖于PAF1C。这些发现揭示了P-TEFb、PAF1C和CDK12在暂停释放及Pol II CTD磷酸化中的协同作用。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。