BCR::ABL1诱导的增强子重编程揭示Ph+B-ALL细胞对增强子靶向药物超敏 [ChIP-Seq]

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE279644

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

为更好地理解BCR::ABL1如何建立Ph+B-ALL特征性转录程序，我们采用整合多组学方法研究Ph+B-ALL细胞的转录组、增强子活性以及增强子与靶基因的三维相互作用。我们运用ChIP-Seq、RNA-Seq及基于Hi-C的方法，对来自人Ph+B-ALL患者和鼠Ph+B-ALL模型的细胞进行了深入分析，以将增强子与其调控的启动子联系起来。我们进一步干扰增强子功能，以探究其在Ph+B-ALL中的作用，并利用靶向蛋白酶体降解和RNA干扰(RNAi)技术，研究了被招募至增强子的BCR::ABL1调控转录因子。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。