通过单细胞转录组测序对儿童急性淋巴细胞白血病细胞进行功能性药物测试以绘制细胞药物反应图谱
儿童急性淋巴细胞白血病单细胞转录组测序数据,用于功能性药物测试,评估多种scRNA-seq方法下的药物反应基因表达图谱。

基本信息
模态
基因组
创建/更新时间
2026-10-07
资源简介
该数据集包含儿童急性淋巴细胞白血病(ALL)细胞的单细胞转录组测序数据,用于功能性药物测试。研究使用糖皮质激素耐药的E/R+ REH细胞作为模型,评估三种单细胞转录组测序(scRNA-seq)方法(Parse Evercode WTK、MULTI-seq和10x Chromium Fixed RNA Profiling),并在五种药物条件下进行实验。数据反映了不同药物条件下的基因表达变化,特别关注氟达拉滨的细胞转录响应。目的是通过功能性精准医学方法,根据个体癌细胞特征匹配药物,为高风险ALL治疗提供依据。
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- OpenDataLab:
数据加载示例(表格/文本类)
import pandas as pd, glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))
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