B-ALL样本及PDX RNA测序数据集

资源简介

B-ALL样本及PDX RNA测序数据集

该数据集为来源于omicsdi.org的一组B-ALL（急性淋巴细胞白血病）样本RNA测序数据集合，归属于肿瘤/急性淋巴细胞白血病分类，主题标签为Genomics。数据覆盖多种B-ALL亚型：5例唐氏综合征（DS）、16例超二倍体（HeH）、6例iAMP21以及9例其他类型；同时纳入3例健康B细胞祖细胞的RNA测序数据作为参照。此外，该数据集还包含由上述B-ALL样本所建立的病人来源异种移植（PDX）模型的RNA测序数据，涵盖4例唐氏综合征、4例超二倍体、1例iAMP21和3例其他类型。整体而言，该数据集围绕B-ALL的转录组特征展开，兼顾患者样本、健康对照与PDX模型三个层面，为白血病亚型的分子特征研究提供了多层次的测序资源。

【数据集背景】

急性淋巴细胞白血病是儿童期常见的血液系统恶性肿瘤，其中B细胞谱系急性淋巴细胞白血病（B-ALL）占据主要比例。B-ALL在遗传学上具有显著异质性，不同亚型在基因组改变、表达谱和临床行为上存在差异。唐氏综合征相关B-ALL、超二倍体、iAMP21等均为具有代表性的亚型。该数据集正是在这一背景下构建，旨在通过RNA测序刻画不同B-ALL亚型样本的转录组特征，并以健康B细胞祖细胞作为对照参照，同时借助病人来源异种移植模型延伸对肿瘤生物学特性的观察。

【数据内容】

数据集包含两大部分RNA测序内容。第一部分为B-ALL患者样本，共覆盖5例唐氏综合征（DS）、16例超二倍体（HeH）、6例iAMP21和9例其他类型；并包含3例健康B细胞祖细胞的RNA测序数据。第二部分为源自上述B-ALL样本的病人来源异种移植（PDX）模型的RNA测序数据，包括4例唐氏综合征、4例超二倍体、1例iAMP21和3例其他类型。数据以RNA测序形式呈现，主题归类为基因组学。

【采集与来源】

该数据集来源于omicsdi.org，数据集英文名称为“5b858c83-27cf-4985-bded-e93cdfdf5a91 - samples”。样本构成包括B-ALL患者样本、健康B细胞祖细胞以及由B-ALL样本建立的PDX模型。其余采集时间、采集地点、测序平台、建库方法等信息源站未提供。

【适用场景】

基于其所覆盖的样本类型，该数据集可用于B-ALL不同遗传学亚型之间转录组特征的比较分析，也可用于患者样本与健康B细胞祖细胞之间的表达谱差异观察；PDX模型部分的测序数据可用于与对应来源B-ALL样本的对照研究。此外，数据可服务于白血病分子分型、亚型特异性表达模式探索等基因组学分析场景。具体分析用途应以源站说明为准，源站未提供更详细的适用场景描述。

【使用方法】

源站未提供具体的使用方法、数据下载方式、文件格式说明及分析流程指引。

【质量与限制】

源站未提供关于数据质量评估、测序深度、样本纳入排除标准、批次效应控制等方面的信息。各亚型样本量不一，其中iAMP21及PDX模型部分样本数量较少，相关分析需注意样本规模带来的限制；此点基于样本数量本身，其余质量相关结论源站未提供。

【引用与许可】

源站未提供引用方式与许可信息。