20例B-ALL样本全外显子测序数据集

该数据集来自 omicsdi.org,为 20 例 B-ALL 样本的全外显子测序数据,涵盖 5 例唐氏综合征、7 例超二倍体、3 例 iAMP21 及 5 例其他类型

omicsdi
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基因组分类Genomics
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基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-19

资源简介

20例B-ALL样本全外显子测序数据集

该数据集为一份聚焦于B细胞急性淋巴细胞白血病(B-ALL)的全外显子测序样本集合,共纳入20例B-ALL样本。根据源站描述,该队列由5例唐氏综合征(Down syndrome,DS)相关样本、7例超二倍体(Hyperdiploid,HeH)样本、3例iAMP21样本以及5例其他类型样本构成,体现了B-ALL在遗传学亚型上的多样性。数据集以基因组学(Genomics)为主题标签,归属于肿瘤/急性淋巴细胞白血病分类,来源于omicsdi.org。整体而言,该数据集提供了覆盖多种B-ALL遗传亚型的全外显子测序材料,可用于围绕B-ALL分子特征的研究探索,尤其适合关注唐氏综合征相关B-ALL、超二倍体及iAMP21等特定亚型的分析工作。

【数据集背景】

急性淋巴细胞白血病是儿童期最常见的恶性肿瘤之一,其中B细胞来源的亚型在遗传学上具有显著的异质性。不同遗传亚型在发病机制、预后分层及治疗策略上存在差异,因此针对特定亚型开展基因组层面的研究具有重要意义。全外显子测序能够覆盖蛋白编码区域及其侧翼序列,是识别编码区变异的重要技术手段。该数据集正是在这一背景下,汇集了20例B-ALL样本的全外显子测序数据,并按照遗传学特征划分为唐氏综合征、超二倍体、iAMP21及其他类型几个组别,为亚型间的比较研究提供了样本基础。本站将其归类于肿瘤/急性淋巴细胞白血病方向,主题标签为基因组学。

【数据内容】

该数据集的核心内容为20例B-ALL样本的全外显子测序数据。按源站描述,样本构成如下:5例来自唐氏综合征(DS)相关B-ALL,7例为超二倍体(HeH)B-ALL,3例为iAMP21亚型,另有5例归入其他类型。上述分组覆盖了儿童B-ALL中若干具有代表性的遗传学亚型。数据集名称中包含“samples”字样,表明其以样本为单位组织。关于具体的测序平台、读长、覆盖深度、文件格式、样本元数据字段以及是否包含配对正常样本等信息,源站未提供。

【采集与来源】

该数据集来源于omicsdi.org。源站描述仅说明这是一项针对20例B-ALL样本的全外显子测序工作,并按DS、HeH、iAMP21及其他类型给出了样本数量分布。关于样本采集机构、采集时间、地理区域、伦理审批信息、原始数据产生的研究项目或发表文献等,源站未提供。

【适用场景】

基于其样本构成,该数据集适用于围绕B-ALL遗传亚型的探索性研究,例如比较唐氏综合征相关B-ALL、超二倍体B-ALL与iAMP21亚型在全外显子层面的变异特征,或用于编码区变异的发现与验证工作。由于队列覆盖多个亚型但样本量有限,其更适合作为亚型特异性分析的素材或与其他队列联合分析的组成部分。关于该数据集在具体研究中的既定用途,源站未提供。

【使用方法】

该数据集以样本集合的形式提供,使用时应先按源站描述所给的亚型分组(DS、HeH、iAMP21及其他)对样本进行归类,再结合研究目的开展外显子层面的分析。由于源站未提供测序平台、文件格式及处理流程等信息,具体的下载方式、数据预处理步骤与分析工具选择需参照源站的实际说明。源站未提供关于数据访问入口、使用协议或分析流程的进一步细节。

【质量与限制】

该数据集的主要局限在于样本量较小,20例样本分配至四个组别后,各组例数分别为5、7、3和5,其中iAMP21组仅3例,统计效力有限。此外,源站描述未涉及测序质量指标、覆盖度、变异检出验证情况以及样本纳入排除标准等信息,相关质量评估内容源站未提供。使用者在开展分析时应自行评估数据质量,并谨慎解读基于小样本得出的结论。

【引用与许可】

关于该数据集的引用方式、原始文献、数据许可协议及使用条款,源站未提供。使用者在引用或再利用该数据前,应查阅omicsdi.org上对应的数据条目以获取准确的引用与许可信息。

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使用方式

数据集获取

源站:https://omicsdi.org/dataset/ega/EGAD00001005425

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

Whole Exome Sequencing for a cohort of 20 B-ALL samples : 5 Down syndrome (DS), 7 Hyperdiploid (HeH), 3 iAMP21 and 5 others.

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