WTCCC 类风湿关节炎病例对照研究 - 合并对照组

该数据集来自 omicsdi.org,为 WTCCC 类风湿关节炎全基因组病例对照关联研究的合并对照组部分。研究整合六个疾病收集组,并以 1958 英国出生队列和英国国家血液服务收集组作为对照

omicsdi
浏览 9
基因组分类Genomics
WTCCC case-control study for Rheumatoid Arthritis - Combined Controls

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-17

资源简介

WTCCC 类风湿关节炎病例对照研究 - 合并对照组

WTCCC case-control study for Rheumatoid Arthritis - Combined Controls 是一个面向类风湿关节炎遗传学研究的全基因组病例对照关联研究数据集,其核心在于为病例对照分析提供合并对照组数据。该数据集归属于肌肉骨骼系统疾病 / 其他分类,主题标签为 Genomics,来源于 omicsdi.org。根据源站描述,该研究采用全基因组关联分析策略,针对类风湿关节炎(Rheumatoid Arthritis, RA)开展病例对照研究,将六个疾病收集组与作为对照的两类人群集合相结合,其中对照来自 1958 英国出生队列(1958 British Birth Cohort)以及英国国家血液服务(UK National Blood Service)收集组。该数据集即为这一研究框架下的合并对照组部分,可用于支撑类风湿关节炎遗传关联分析中的对照侧数据需求。

【数据集背景】

类风湿关节炎是一种累及关节的慢性疾病,属于肌肉骨骼系统疾病范畴。为从遗传学角度探索该疾病的易感因素,WTCCC 开展了针对类风湿关节炎的全基因组病例对照关联研究。该研究的设计特点在于病例侧整合了六个疾病收集组,而对照侧则采用两个大规模人群来源,即 1958 英国出生队列与英国国家血液服务收集组。本数据集对应其中的合并对照组部分,其英文名称为 WTCCC case-control study for Rheumatoid Arthritis - Combined Controls,主题聚焦于基因组学。

【数据内容】

该数据集的内容为类风湿关节炎全基因组病例对照关联研究中的合并对照组数据。源站描述表明,研究使用六个疾病收集组与两类对照收集组共同构成病例对照框架,本数据集所涵盖的是对照侧的组合部分。关于具体的样本数量、基因分型平台、位点数量、数据文件格式与字段结构等信息,源站未提供。

【采集与来源】

数据来源站为 omicsdi.org。对照样本的来源在源站描述中有明确说明,包括 1958 英国出生队列和英国国家血液服务收集组,二者共同作为该全基因组关联研究的对照来源。病例侧则来自六个疾病收集组。关于各收集组的具体招募地点、采集时间、伦理审批信息以及样本处理流程,源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于类风湿关节炎的全基因组病例对照关联分析,尤其是需要采用大规模人群对照的遗传关联研究场景。由于对照来自 1958 英国出生队列与英国国家血液服务收集组,其设计可用于与六个疾病收集组的病例数据进行对照比较,从而评估遗传变异与类风湿关节炎之间的关联。此外,该数据集也可作为基因组学研究中对照数据组合与整合的参考。关于其他具体应用场景,源站未提供。

【使用方法】

该数据集作为合并对照组部分,预期用于与相应的类风湿关节炎病例数据进行配套分析,构成完整的病例对照关联研究设计。关于数据下载方式、访问入口、文件组织方式、分析流程与软件工具建议等,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集为特定研究项目中的合并对照组数据,其对照构成来自 1958 英国出生队列与英国国家血液服务收集组两个来源。关于样本质量控制指标、基因分型成功率、人群分层评估、数据完整性以及使用限制等信息,源站未提供。

【引用与许可】

关于该数据集的引用方式、许可协议与使用条款,源站未提供。

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源站:https://omicsdi.org/dataset/ega/EGAS00000000012

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

WTCCC针对类风湿关节炎(RA)的全基因组病例对照关联研究,使用了六个疾病收集样本,并以1958年英国出生队列和英国国家血液服务收集样本作为对照。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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