儿童T细胞急性淋巴细胞白血病骨髓转录组表达谱：持续完全缓解与复发对比
该数据集来自 omicsdi.org，收录儿童 T 细胞急性淋巴细胞白血病（T-ALL）骨髓样本的转录组表达谱，使用 Affymetrix HG-U133A 芯片比较持续完全缓解（CCR，n=7）与复发（n=5）两组患儿
基本信息
资源简介
儿童T细胞急性淋巴细胞白血病骨髓转录组表达谱：持续完全缓解与复发对比
该数据集来自 omicsdi.org，收录儿童 T 细胞急性淋巴细胞白血病（T-ALL）骨髓样本的转录组表达谱，使用 Affymetrix HG-U133A 芯片比较持续完全缓解（CCR，n=7）与复发（n=5）两组患儿。研究者采用基于决策树的监督学习算法 Random Forest 对基因区分两组的能力进行排序，并从排名前 300 的探针集中选出 9 个基因，在 25 例 T-ALL 独立队列中用实时定量 PCR 进一步验证。数据可用于复发相关基因表达特征挖掘与分类模型构建（来源 omicsdi.org）。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：我们使用 Affymetrix HG-U133A 芯片，比较了一组持续完全缓解（CCR）（n = 7）的儿童 T 细胞急性淋巴细胞白血病患者与一组复发患者（n = 5）的基因表达谱。使用基于决策树的监督学习算法 Random Forest（RF），根据基因区分持续完全缓解患者与复发患者的能力对基因进行排序。从排名前 300 的探针集中选出 9 个基因，在 25 例 T-ALL 患者的独立队列中使用实时定量聚合酶链反应进一步研究和验证。
【主题与分类】
主题标签：Transcriptomics。本站分类：肌肉骨骼系统疾病。
【获取与许可】
源站页面：https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-TABM-255
下载信息
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数据集获取
源站：https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-TABM-255
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
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- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
我们比较了一组持续完全缓解（CCR）的T细胞急性淋巴细胞白血病患儿（n=7）与一组复发患儿（n=5）的基因表达谱，使用Affymetrix HG-U133A芯片进行检测。采用基于决策树的监督学习算法随机森林（RF），根据基因区分持续CCR患者与复发患者的能力对其进行排序。从排名前300的探针组中选取9个基因，在由25例T-ALL患者组成的独立队列中，采用定量实时聚合酶链反应进行进一步研究和验证。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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