复发多发性骨髓瘤的分子特征数据集
该数据集来源于 omicsdi.org,收录多发性骨髓瘤患者新鲜的人 CD138+ 骨髓浆细胞转录组数据,涵盖新诊断的高剂量治疗候选者(N,n=29)、既往接受高剂量治疗后首次进展(R1,n=27)或更晚进展(R2+,n=11)的患者
基本信息
资源简介
复发多发性骨髓瘤的分子特征数据集
该数据集英文名为 The Molecular Characterization of Myeloma at Relapse,来源于 omicsdi.org,本站归类于肌肉骨骼系统疾病 / 其他。数据集收录多发性骨髓瘤患者新鲜的人 CD138+ 骨髓浆细胞转录组数据,涵盖三类患者:新诊断的高剂量治疗候选者(N,n=29)、既往接受高剂量治疗后首次出现进展性疾病者(R1,n=27)以及更晚阶段进展者(R2+,n=11)。研究将基因表达数据与临床资料进行对照分析,临床信息包括 FISH 高危状态、ISS 分期、无进展生存期和总生存期,中位随访时间为 65.9 个月(范围 41.5–86.6 个月)。主题标签为 Transcriptomics。
【数据集背景】
多发性骨髓瘤是一种发生于骨髓浆细胞的恶性疾病,患者在接受高剂量治疗后常出现疾病进展或复发。理解疾病在复发阶段的分子特征,对于揭示耐药与进展机制、评估风险分层具有重要意义。该数据集正是围绕“复发时多发性骨髓瘤的分子特征”这一主题构建,通过比较新诊断患者与不同进展阶段患者的骨髓浆细胞基因表达,结合临床风险与生存信息,为研究疾病进展的分子基础提供数据支撑。
【数据内容】
数据集的核心内容是来自多发性骨髓瘤患者新鲜的人 CD138+ 骨髓浆细胞的转录组数据。样本按临床状态分为三组:新诊断的高剂量治疗候选者(N,n=29)、既往接受高剂量治疗后首次进展的患者(R1,n=27)以及更晚阶段进展的患者(R2+,n=11)。除基因表达数据外,数据集还配套临床资料,包括 FISH 高危状态、ISS 分期、无进展生存期和总生存期。中位随访时间为 65.9 个月,随访范围 41.5 至 86.6 个月。主题标签为 Transcriptomics,表明数据属于转录组学范畴。
【采集与来源】
数据集来源于 omicsdi.org。样本为新鲜的人 CD138+ 骨髓浆细胞,取自多发性骨髓瘤患者。源站描述中给出了各组样本的例数及临床状态划分,并说明基因表达数据与临床数据进行了比较分析。关于具体的样本采集流程、测序平台、试剂与仪器型号等信息,源站未提供。
【适用场景】
基于其转录组数据与临床信息的组合,该数据集适用于多发性骨髓瘤复发相关分子特征的研究场景,例如比较新诊断与不同进展阶段患者骨髓浆细胞基因表达的差异、探索基因表达与 FISH 高危状态或 ISS 分期的关联、以及分析基因表达与无进展生存期和总生存期等临床结局的关系。主题标签为 Transcriptomics,也提示其可用于转录组学层面的方法验证与探索性分析。其他具体应用方向源站未提供。
【使用方法】
源站未提供具体的使用方法说明,包括数据下载方式、文件格式、预处理流程与分析工具等均未提及。使用者需依据来源站 omicsdi.org 的相应条目获取进一步信息。
【质量与限制】
源站描述中给出了各组样本量(N,n=29;R1,n=27;R2+,n=11)以及随访时间信息(中位 65.9 个月,范围 41.5–86.6 个月),但未提供数据质量评估、批次效应、缺失值处理或验证结果等信息。关于样本量对统计效能的影响、数据覆盖度等质量相关细节,源站未提供。使用时应注意各组样本量存在差异,尤其 R2+ 组例数较少。
【引用与许可】
源站未提供引用方式与许可信息。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-MTAB-3660
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
Fresh, human CD138+ bone marrow plasma cells from multiple myeloma patients: newly diagnosed high-dose treatment candidates (N, n=29), previously high-dose treated patients experiencing first-time progressive disease (R1, n=27) or later (R2+, n=11). Gene expression compared with clinical data, including FISH high-risk status, ISS stage, progression-free survival, and overall survival. Median follow-up was 65.9 months (range 41.5-86.6).
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