线粒体钙单向转运体在体内调控骨骼肌质量

数据集获取

源站：https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-GEOD-60931

标准获取流程：

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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

肌肉萎缩是许多病理生理状况预后不良的重要因素，但药物治疗手段仍然有限。肌肉活动会引起线粒体[Ca2+]的显著波动，这些波动调控有氧代谢、细胞死亡与存活通路。我们通过过表达或沉默线粒体钙单向转运体（MCU），在体内研究了线粒体Ca2+稳态对骨骼肌功能和营养状态的影响。结果一致表明，在发育期和成年期肌肉中，MCU依赖的线粒体Ca2+摄取均具有显著的营养效应，该效应不依赖于自噬或有氧调控，而是作用于骨骼肌两条主要的肥大通路——PGC-1M-NM-14和Igf1-Akt/PKB。在成年小鼠中，MCU过表达可防止去神经支配诱导的萎缩。这些数据揭示了一条新的Ca2+依赖性细胞器至细胞核信号传导途径，将线粒体功能与肌肉质量调控联系起来，并可能成为肌少症的潜在药理学靶点。实验在单根骨骼肌纤维的生物学重复样本上进行。

选取了七根纤维，因其线粒体钙单向转运体（MCU）过表达，另选七根纤维则因MCU被沉默。过表达与沉默操作通过向骨骼肌注射含MCU基因的腺相关病毒（AAV）或针对MCU的特异性短干扰寡核苷酸实现。作为对照，分析了八根转染AAV的纤维及八根野生型纤维。分析在AAV注射后7天和14天进行（MCU过表达与沉默组：7天后3根纤维，14天后4根纤维；对照组：7天后4根纤维，14天后4根纤维）。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。