用于衰老原型诊断的 Stockholm 数据集
该数据集来自 omicsdi.org，包含健康男性受试者在基线状态下的骨骼肌活检样本，受试者年龄分为小于29岁和大于59岁两组
基本信息
资源简介
用于衰老原型诊断的 Stockholm 数据集
Stockholm dataset for ageing prototype diagnostic 是一个面向健康生理年龄分子诊断原型研究的转录组学数据集，来源于 omicsdi.org，在疾病分类上归属于肌肉骨骼系统疾病 / 其他类别。该数据集的核心样本为健康男性受试者在基线状态下采集的骨骼肌活检组织，受试者按年龄划分为小于29岁和大于59岁两个组别。样本采集条件为隔夜空腹后的静息骨骼肌，旨在为多组织分子诊断原型的构建提供基础数据。数据集与 GSE18583 存在关联，主题标签为 Transcriptomics，整体聚焦于利用骨骼肌转录组信息探索健康生理年龄的分子特征。
【数据集背景】
该数据集服务于健康生理年龄分子诊断原型的开发。研究关注的是健康男性在基线状态下的骨骼肌分子特征，通过比较年轻组（小于29岁）与年长组（大于59岁）的样本，为构建多组织分子诊断原型提供数据基础。数据集与 GSE18583 相关联，主题标签为 Transcriptomics，说明其核心数据类型为转录组学数据。该数据集在分类上属于肌肉骨骼系统疾病 / 其他，但其样本来源于健康受试者，而非疾病患者，这一点对于理解其用途至关重要。
【数据内容】
数据集包含健康男性受试者在基线状态下的骨骼肌活检样本。受试者被划分为两个年龄范围：小于29岁和大于59岁。样本类型为静息骨骼肌样本，采集条件为隔夜空腹后。这些样本被用于设计多组织分子诊断的健康生理年龄原型。主题标签为 Transcriptomics，表明数据内容以转录组学信息为主。数据集与 GSE18583 相关。除上述信息外，源站未提供关于样本数量、具体基因表达指标、测序平台或数据处理细节的更多内容。
【采集与来源】
样本采集自健康男性受试者，采集部位为骨骼肌，采集状态为静息状态，且要求受试者经过隔夜空腹。受试者按年龄分为小于29岁和大于59岁两组。数据来源站为 omicsdi.org。源站描述中提及这些样本用于设计健康生理年龄的多组织分子诊断原型，并与 GSE18583 相关。关于采集地点、采集时间、伦理审批信息、受试者招募方式等，源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于健康生理年龄分子诊断原型的开发与验证研究，尤其是基于骨骼肌转录组信息探索年龄相关分子特征的工作。由于样本来自健康男性且按年龄分组，可用于比较年轻与年长个体在基线状态下的骨骼肌分子差异。其转录组学主题标签表明，适合用于转录组层面的分析。此外，该数据集与 GSE18583 相关，可能适用于与该项目相关的联合分析或验证研究。关于具体分析场景、疾病关联或临床应用，源站未提供更多信息。
【使用方法】
源站未提供具体的使用方法说明，包括数据下载方式、预处理流程、分析工具或代码等。用户需参考 omicsdi.org 及 GSE18583 相关页面获取进一步信息。关于数据格式、标准化方法或质量控制步骤，源站未提供。
【质量与限制】
该数据集的样本仅来自健康男性受试者，年龄分组为小于29岁和大于59岁，未涵盖其他性别或中间年龄段的个体。样本类型为静息骨骼肌，采集条件为隔夜空腹，这些条件可能限制其在外推至其他组织、其他生理状态或其他人群时的适用性。源站未提供关于样本量、数据完整性、批次效应或技术重复等信息。此外，该数据集用于原型设计，而非最终诊断工具，其结论的稳健性和泛化能力需进一步验证。关于数据质量的具体指标，源站未提供。
【引用与许可】
源站未提供该数据集的引用方式或许可信息。用户需参考 omicsdi.org 及 GSE18583 相关页面获取引用要求和许可条款。关于数据使用限制、商业用途或再分发条件，源站未提供。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-GEOD-59880
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
来自健康男性受试者的基线肌肉活检样本，年龄范围属于<29岁或>59岁。这些样本用于设计健康生理年龄的多组织分子诊断原型。过夜禁食后的静息骨骼肌样本。与GSE18583相关。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
需要用于商业化训练或医疗器械注册（NMPA/FDA）？
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连，提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。
