SPIDER:MR图像腰椎分割数据集与公开基准

SPIDER 是一个公开的多中心腰椎磁共振成像数据集,包含来自 218 名有下背痛病史患者的 447 个矢状位 T1 和 T2 MRI 序列,数据采集自四家医院

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2024-03-05 更新
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医学影像图像分割MRIlow back pain腰椎分割医学影像图像分割多中心数据
SPIDER - Lumbar spine segmentation in MR images: a dataset and a public benchmark

基本信息

模态
医学影像
大小
3.758940056 GB
任务类型
图像分割
许可
cc-by-4.0
创建/更新时间
2024-03-05

资源简介

SPIDER:MR图像腰椎分割数据集与公开基准

SPIDER - Lumbar spine segmentation in MR images: a dataset and a public benchmark

SPIDER 是一个公开的多中心腰椎磁共振成像数据集,包含来自 218 名有下背痛病史患者的 447 个矢状位 T1 和 T2 MRI 序列,数据采集自四家医院。数据集提供椎骨、椎间盘和椎管的参考分割,并附有训练/验证集划分、患者生物学性别及部分年龄信息。该数据可用于腰椎结构分割算法的训练与评估,并作为 SPIDER 挑战赛的公开基准,促进脊柱分割研究与腰椎 MRI 诊断价值的提升(来源 Zenodo,cc-by-4.0 许可)。

【数据集背景】

源站首次发布:2023-11-20。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):这是一个大型公开可用的多中心腰椎磁共振成像(MRI)数据集,包含椎骨、椎间盘(IVDs)和椎管的参考分割。该数据集包括来自 218 名有下背痛病史患者的 218 项研究的 447 个矢状位 T1 和 T2 MRI 序列。数据采集自四家不同的医院。还有一个额外的隐藏测试集,不在此处提供,用于 spider.grand-challenge.org 上伴随的 SPIDER 挑战赛。我们共享这些数据,以鼓励更广泛的参与和合作,推动脊柱分割领域的发展,并最终提高腰椎 MRI 的诊断价值。哪些 MRI 研究被分配到训练集和验证集可在概览文件中找到。该文件还提供了所有患者的生物学性别以及有可用信息的患者的年龄。它还

【数据结构与技术规格】

文件数 4 个,合计 3.76 GB。数据集 DOI:10.5281/zenodo.10159290。

【主题与分类】

主题标签:MRI、low back pain、腰椎分割、医学影像、图像分割、多中心数据。本站分类:肌肉骨骼系统疾病。

【获取与许可】

源站页面:https://zenodo.org/records/10159290

使用许可:cc-by-4.0。

【使用注意】

· 源站最后修改于 2024-03-05,引用时请注意版本时效。

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curl -L -o "images.zip" "https://zenodo.org/api/records/10159290/files/images.zip/content"
curl -L -o "overview.csv" "https://zenodo.org/api/records/10159290/files/overview.csv/content"

文件清单

  • masks.zip(55.5 MB)
  • radiological_gradings.csv(0.0 MB)
  • images.zip(3529.1 MB)
  • overview.csv(0.1 MB)

数据集大小约 3.76 GB。

数据说明

这是一个大型公开可用的多中心腰椎磁共振成像(MRI)数据集,包含椎骨、椎间盘(IVD)和椎管的参考分割。该数据集包括来自218名有下背痛病史患者的218项研究的447个矢状位T1和T2 MRI序列。数据采集自四家不同的医院。还有一个额外的隐藏测试集,此处不可用,用于spider.grand-challenge.org上随附的SPIDER挑战赛。我们共享这些数据,以鼓励更广泛地参与和合作脊柱分割领域,并最终提高腰椎MRI的诊断价值。哪些MRI研究被分配到训练集和验证集可在概览文件中找到。该文件还提供了所有患者的生理性别以及有可用信息的患者的年龄。它还包括每个单独MRI研究的一些扫描仪和采集参数。

该数据集还附带一个单独文件,其中包含以下退行性改变的放射学分级:1.    Modic改变(I型、II型或III型)2.    上、下终板改变/Schmorl结节(二分类)3.    脊椎滑脱(二分类)4.    椎间盘突出(二分类)5.    椎间盘狭窄(二分类)6.    椎间盘膨出(二分类)7.    Pfirrman分级(1级至5级)。所有放射学分级均按IVD节段提供。该数据集及相关的公开基准见本文:https://www.nature.com/articles/s41597-024-03090-w 公开分割挑战赛见:https://spider.grand-challenge.org/ 使用本数据集时,请使用正确的DOI引用本数据集,并同时引用上述论文。

许可

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