人类肌肉肌腱单位单核RNA测序:肌腱连接处

该数据集来自omicsdi.org,为人类肌肉肌腱单位的单核RNA测序数据,聚焦于肌腱连接处。研究对三例人类半腱肌-肌腱活检组织的肌肉与肌腱交界区域进行单核RNA测序,以鉴定其中的细胞类型,并特别关注肌腱连接处特异性肌核,所鉴定出的转录本通过免疫荧光在肌腱连接处得到确认

omicsdi
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基因组分类Transcriptomics
Single-nucleus RNA-seq of the human musculotendinous unit, the myotendinous junction

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-08

资源简介

人类肌肉肌腱单位单核RNA测序:肌腱连接处

该数据集为人类肌肉肌腱单位的单核RNA测序数据,聚焦于肌腱连接处(myotendinous junction)。研究通过对三例人类半腱肌-肌腱活检组织的肌肉与肌腱交界区域进行单核RNA测序,旨在鉴定该交界区域内的细胞类型,并特别关注肌腱连接处特异性的肌核。研究所鉴定出的转录本进一步通过免疫荧光在肌腱连接处得到确认。该数据集的主题标签为转录组学(Transcriptomics),在分类上归属于肌肉骨骼疾病 / 其他。数据来源于omicsdi.org。整体而言,该数据集为理解肌肉与肌腱交界区域的细胞组成及其分子特征提供了单核转录组层面的资源,尤其有助于识别肌腱连接处特异性的肌核及其转录本特征。

【数据集背景】

肌肉与肌腱之间的连接区域,即肌腱连接处,是肌肉与肌腱两种组织相互衔接的界面。该区域在结构上承担力学传递的功能,在细胞与分子层面则可能包含特定的细胞类型和转录特征。然而,针对人类肌腱连接处的细胞类型鉴定及其特异性肌核的转录组研究仍较为有限。该数据集正是围绕这一交界区域展开,利用单核RNA测序技术,对人类半腱肌-肌腱活检组织中的肌肉与肌腱交界区域进行分析,以鉴定其中的细胞类型,并特别聚焦于肌腱连接处特异性的肌核。研究进一步通过免疫荧光对鉴定出的转录本在肌腱连接处进行确认,从而在转录本层面为该区域的分子特征提供验证。

【数据内容】

该数据集的核心内容为人类肌肉肌腱单位的单核RNA测序数据,具体针对肌肉与肌腱交界区域。研究对三例人类半腱肌-肌腱活检组织进行单核RNA测序,以鉴定该交界区域中的细胞类型。数据特别关注肌腱连接处特异性的肌核,并在此基础上鉴定相关转录本。所鉴定出的转录本通过免疫荧光在肌腱连接处得到确认。主题标签为转录组学。除上述信息外,关于数据的具体样本数量、测序深度、细胞核数量、转录本数量、基因表达矩阵的具体形式、是否包含原始数据或处理后数据等细节,源站未提供。

【采集与来源】

该数据集来源于omicsdi.org。研究材料为三例人类半腱肌-肌腱活检组织,取自肌肉与肌腱的交界区域。研究采用单核RNA测序技术对上述活检组织进行分析,以鉴定肌肉与肌腱交界区域的细胞类型。在单核RNA测序之外,研究还使用免疫荧光方法对鉴定出的转录本在肌腱连接处进行确认。关于活检组织的具体采集方式、供体信息、伦理审批信息、样本处理流程、测序平台、试剂来源等细节,源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于与肌肉骨骼系统相关的转录组学研究,尤其是针对肌肉与肌腱交界区域、肌腱连接处细胞类型鉴定及特异性肌核转录特征分析的研究场景。由于数据聚焦于人类肌肉肌腱单位的单核RNA测序,可用于探索肌肉与肌腱交界区域的细胞组成、肌腱连接处特异性肌核的转录本特征,以及相关转录本在组织中的定位验证。主题标签为转录组学,因此也适用于转录组层面的数据挖掘与比较分析。关于该数据集是否适用于其他特定疾病、发育阶段或物种比较等场景,源站未提供。

【使用方法】

该数据集来自omicsdi.org,可通过该来源站获取。研究基于三例人类半腱肌-肌腱活检组织的单核RNA测序数据,聚焦于肌肉与肌腱交界区域,并特别关注肌腱连接处特异性肌核。使用时可围绕细胞类型鉴定、肌腱连接处特异性肌核的转录本分析以及免疫荧光确认结果展开。关于具体的数据下载方式、文件格式、分析流程、软件工具、参数设置以及是否提供配套代码等,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集基于三例人类半腱肌-肌腱活检组织,样本数量有限。研究通过单核RNA测序鉴定细胞类型,并特别关注肌腱连接处特异性肌核,所鉴定出的转录本通过免疫荧光在肌腱连接处得到确认,这为转录本层面的发现提供了组织定位层面的验证。然而,关于测序质量指标、细胞核捕获效率、批次效应、生物学重复的一致性、免疫荧光验证的具体转录本数量与验证范围等,源站未提供。此外,该数据集聚焦于人类半腱肌-肌腱活检组织的肌肉与肌腱交界区域,其结论是否可推广至其他肌肉、其他肌腱或其他个体,源站未提供。

【引用与许可】

该数据集来源于omicsdi.org。关于该数据集的引用方式、原始文献、作者信息、发表期刊、DOI、数据许可协议、使用条款以及是否允许再分发或商业使用等,源站未提供。

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源站:https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-MTAB-12529

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  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

通过对三份人类半腱肌-肌腱活检样本进行单核RNA测序,鉴定了肌肉与肌腱交界处的细胞类型。特别聚焦于肌腱连接处特异性肌核,识别了转录本,并通过免疫荧光技术在肌腱连接处进行了确认。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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