WT与gunmetal小鼠FACS分选CD41+骨髓细胞的单细胞RNA-seq分析

数据集获取

源站：https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-MTAB-17643

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

蛋白质异戊二烯化对于信号传导和运输蛋白的膜定位至关重要。我们在来自19个近亲家庭的23名患者中发现了一种反复出现的纯合RABGGTA错义变异（L235F），这些患者患有一种严重的多系统疾病，其特征为双系血细胞减少、反复感染、全身性炎症和危及生命的出血。该变异使Rab香叶基香叶基转移酶不稳定，导致广泛的Rab低异戊二烯化、错误定位和囊泡运输缺陷。RABGGTA缺陷损害了巨核细胞成熟、血小板颗粒生成和聚集，以及细胞毒性淋巴细胞功能，导致巨血小板减少症和HLH样炎症。转录组学和蛋白质组学分析揭示了囊泡运输和应激反应通路的广泛失调。Rabggta完全缺失在小鼠中是胚胎致死的，而亚效型gunmetal小鼠重现了人类疾病的关键血液学和炎症特征。因此，RABGGTA缺陷定义了人类中首个蛋白质异戊二烯基转移酶功能的孟德尔遗传病，并揭示Rab异戊二烯化是血小板和免疫稳态的关键调节因子。

本数据集对应于从野生型和gunmetal小鼠中通过FACS分选的CD41+骨髓细胞的单细胞RNA测序。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。