免疫再生障碍性贫血单细胞特征研究：体内实验

数据集获取

源站：https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-MTAB-13485

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

免疫性再生障碍性贫血（AA）是一种危及生命的骨髓（BM）衰竭性疾病，由自身免疫性T细胞攻击造血干/祖细胞（HSPCs）所驱动。然而，其自身抗原靶点及其他免疫细胞的作用尚不清楚。本研究通过联合应用scRNA+TCRαβ-seq、TCRβ-seq、流式细胞术及血浆细胞因子谱分析，对超过250例AA患者、超过250例其他血液系统疾病患者及超过1,000例健康对照进行分析，鉴定出表达NK受体且具有AA相关TCRB-seq基序的NK细胞和CD8+ TEMRA细胞是AA骨髓中失调最为显著的免疫细胞群体。利用原代HSPCs和免疫细胞进行的功能性共培养实验（共55种条件）并结合scRNA-TCRαβ-seq读取结果，提供证据表明：单独NK细胞不能杀伤HSPCs，但可使其对CD8+ T细胞介导的杀伤作用敏感化。此外，HSPCs可诱导具有CD8+ TEMRA NK样表型及AA相关TCR基序的T细胞克隆强烈活化。综上所述，本研究结果揭示了AA中固有免疫细胞与适应性免疫细胞的趋同演化，其中NK细胞支持CD8+ T细胞介导的自身免疫反应。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。