脓毒症改变NK细胞应激、肌动蛋白重塑及胞内运输转录程序[数据]

数据集获取

源站：https://doi.org/10.11588/DATA/IMEOVD

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数据说明

背景：自然杀伤（NK）细胞对转化细胞和感染细胞发挥细胞毒性作用。在人类脓毒症中，已报道存在抑制性NK细胞受体特征及效应分子表达缺陷。然而，该表型背后的转录机制仍不明确。方法：我们分析了来自脓毒症患者、全身炎症反应综合征（SIRS）患者及术前对照者的分离外周NK细胞的微阵列转录组图谱。对经典通路、生物学过程及细胞区室进行了富集分析。使用多重分支DNA检测在独立队列中验证了差异基因表达。通过流式细胞术在独立患者样本中评估了离体STAT磷酸化功能性反应及增殖标志物表达。结果：脓毒症患者的NK细胞显示出提示DNA复制应激、内质网应激、细胞骨架动力学及囊泡运输改变的转录特征。

尽管增殖相关转录程序富集，NK细胞的Ki-67表达并未增加，提示增殖活性受损。相比之下，SIRS患者的NK细胞表现出免疫信号通路下调。结论：本研究识别了脓毒症期间循环NK细胞中早期应激相关转录程序及亚细胞结构受损。DNA复制失调与内质网应激反应异常，以及与小GTP酶信号受损相关的囊泡运输改变，可能促成脓毒症中NK细胞功能障碍，并可能为危重症中基于NK细胞的免疫治疗策略开发提供依据。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。