中国患者Duchenne肌营养不良症突变筛查及突变机制研究数据集
研究对 119 例中国 DMD 患者使用 MLPA 和 DHPLC 结合 Sanger 测序筛查 DMD 突变,识别出 11 例小突变(9.2%)和 81 例缺失/重复(68.1%),并分析了 64 例缺失病例的断裂点频率

基本信息
资源简介
中国患者Duchenne肌营养不良症突变筛查及突变机制研究数据集
Screening of Duchenne Muscular Dystrophy (DMD) Mutations and Investigating Its Mutational Mechanism in Chinese Patients
该数据集来自 plos.figshare.com,配套 2014 年发表于 PLoS ONE 的论文,包含 4 个补充表格文件(Table_S1.docx 至 Table_S4.docx)。研究对 119 例中国 DMD 患者使用 MLPA 和 DHPLC 结合 Sanger 测序筛查 DMD 突变,识别出 11 例小突变(9.2%)和 81 例缺失/重复(68.1%),并分析了 64 例缺失病例的断裂点频率。数据可用于 DMD 突变谱、断裂点分布及遗传咨询相关研究(来源 figshare,CC BY 4.0 许可)。
【数据集背景】
配套论文《Screening of Duchenne Muscular Dystrophy (DMD) Mutations and Investigating Its Mutational Mechanism in Chinese Patients》发表于 PLoS ONE(2014),DOI:10.1371/journal.pone.0108038。源站首次发布:2014-09-22。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):Duchenne肌营养不良症(DMD)是一种常见的X连锁隐性肌肉退化和致死性疾病。为了提供准确可靠的遗传咨询和产前诊断,我们使用多重连接依赖探针扩增(MLPA)和变性高效液相色谱(DHPLC)结合Sanger测序,在一组119例中国患者中筛查了DMD突变。在这些无亲缘关系的DMD患者中,我们鉴定出11例携带DMD小突变(9.2%)和81例携带DMD缺失/重复(del/dup)(68.1%),其中64例(79.0%)为缺失,16例(19.8%)为重复,1例(1.2%)同时存在缺失和重复。此外,我们通过计算特定外显子间隔的外显子缺失事件,分析了64例缺失病例中DMD断裂点的频率,揭示了一个新的突变热点边界。为了探究为何DMD重排
【数据结构与技术规格】
文件数 4 个,合计 138.09 KB。数据集 DOI:10.1371/journal.pone.0108038。
【主题与分类】
源站学科分类:Uncategorised。主题标签:Duchenne muscular dystrophy、exon interval、DMD breakpoint、Chinese Patients Duchenne、DMD rearrangement breakpoints、dhplc、DMD gene rearrangements、64 deletion cases、DMD mutations、SNP microarray assay。本站分类:肌肉骨骼疾病/其他。
【适用方向】
源站学科分类标注为 Uncategorised。
【获取与许可】
源站页面:https://plos.figshare.com/articles/dataset/Screening_of_Duchenne_Muscular_Dystrophy_DMD_Mutations_and_Investigating_Its_Mutational_Mechanism_in_Chinese_Patients/1177178
使用许可:CC BY 4.0(https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/)。
规范引用:Chen, Chen; Ma, Hongwei; Zhang, Feng; Chen, Lu; Xing, Xuesha; Wang, Shusen; et al. (2016). Screening of Duchenne Muscular Dystrophy (DMD) Mutations and Investigating Its Mutational Mechanism in Chinese Patients. PLOS ONE. Dataset
【使用注意】
· 源站最后修改于 2023-05-30,引用时请注意版本时效。
下载信息
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数据集获取(Figshare)
- 源站标题:Screening of Duchenne Muscular Dystrophy (<i>DMD</i>) Mutations and Investigating Its Mutational Mechanism in Chinese Patients
- DOI:10.1371/journal.pone.0108038
- 发布日期:2014-09-22
- 文件数:4 个
- 文件总体积:138.09 KB
- 源站页面:https://plos.figshare.com/articles/dataset/Screening_of_Duchenne_Muscular_Dystrophy_DMD_Mutations_and_Investigating_Its_Mutational_Mechanism_in_Chinese_Patients/1177178
命令行下载
curl -L -o "Table_S1.docx" "https://ndownloader.figshare.com/files/1684888"
curl -L -o "Table_S2.docx" "https://ndownloader.figshare.com/files/1684889"
curl -L -o "Table_S3.docx" "https://ndownloader.figshare.com/files/1684890"
curl -L -o "Table_S4.docx" "https://ndownloader.figshare.com/files/1684892"
文件清单
Table_S1.docx(13.48 KB)Table_S2.docx(41.23 KB)Table_S3.docx(44.97 KB)Table_S4.docx(38.40 KB)
文件总体积 138.09 KB(源站 API 实测)。
数据说明
杜氏肌营养不良症(DMD)是一种常见的X连锁隐性遗传性肌肉退行性疾病,可导致死亡。为了提供准确可靠的遗传咨询和产前诊断,我们采用多重连接依赖探针扩增(MLPA)和变性高效液相色谱(DHPLC)结合Sanger测序,对119例中国患者的DMD突变进行了筛查。在这些无亲缘关系的DMD患者中,我们鉴定出11例携带DMD小突变(9.2%)和81例携带DMD缺失/重复(del/dup)(68.1%),其中64例(79.0%)为缺失,16例(19.8%)为重复,1例(1.2%)同时存在缺失和重复。此外,我们通过计算特定外显子区间的外显子缺失事件,分析了64例缺失病例中DMD断裂点的频率,揭示了一个新的突变热点边界。为探究DMD重排断裂点为何易集中于特定区域(热点),我们采用高分辨率SNP微阵列检测技术,在核苷酸水平上对21例DMD外显子缺失/重复患者的断裂点连接序列进行了精确表征。
未发现完全重现的断裂点,单外显子缺失/重复与多外显子缺失/重复病例之间也无显著差异。本研究数据为临床实践中检测DMD突变提供了全面的策略,并通过计算特定外显子区间的外显子缺失事件,确定了外显子43–55和外显子10–23两个缺失热点。此外,这是首个在中国人群中以核苷酸水平描述DMD断裂点特征的研究。我们的观察结果有助于更好地理解DMD基因重排的机制。
许可
CC BY 4.0
引用
学术使用请引用 DOI 10.1371/journal.pone.0108038(source: https://plos.figshare.com/articles/dataset/Screening_of_Duchenne_Muscular_Dystrophy_DMD_Mutations_and_Investigating_Its_Mutational_Mechanism_in_Chinese_Patients/1177178)。
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