中国患者Duchenne肌营养不良症突变筛查及突变机制研究数据集

研究对 119 例中国 DMD 患者使用 MLPA 和 DHPLC 结合 Sanger 测序筛查 DMD 突变,识别出 11 例小突变(9.2%)和 81 例缺失/重复(68.1%),并分析了 64 例缺失病例的断裂点频率

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2023-05-30 更新
浏览 9
基因组分类Duchenne muscular dystrophyexon intervalDMD breakpointChinese Patients DuchenneDMD rearrangement breakpointsdhplcDMD gene rearrangements64 deletion casesDMD mutationsSNP microarray assaynucleotide levelmlpa
Screening of Duchenne Muscular Dystrophy (DMD) Mutations and Investigating Its Mutational Mechanism in Chinese Patients

基本信息

模态
基因组
大小
0.000138093 GB
任务类型
分类
许可
CC BY 4.0
创建/更新时间
2023-05-30
版本
v1

资源简介

中国患者Duchenne肌营养不良症突变筛查及突变机制研究数据集

Screening of Duchenne Muscular Dystrophy (DMD) Mutations and Investigating Its Mutational Mechanism in Chinese Patients

该数据集来自 plos.figshare.com,配套 2014 年发表于 PLoS ONE 的论文,包含 4 个补充表格文件(Table_S1.docx 至 Table_S4.docx)。研究对 119 例中国 DMD 患者使用 MLPA 和 DHPLC 结合 Sanger 测序筛查 DMD 突变,识别出 11 例小突变(9.2%)和 81 例缺失/重复(68.1%),并分析了 64 例缺失病例的断裂点频率。数据可用于 DMD 突变谱、断裂点分布及遗传咨询相关研究(来源 figshare,CC BY 4.0 许可)。

【数据集背景】

配套论文《Screening of Duchenne Muscular Dystrophy (DMD) Mutations and Investigating Its Mutational Mechanism in Chinese Patients》发表于 PLoS ONE(2014),DOI:10.1371/journal.pone.0108038。源站首次发布:2014-09-22。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):Duchenne肌营养不良症(DMD)是一种常见的X连锁隐性肌肉退化和致死性疾病。为了提供准确可靠的遗传咨询和产前诊断,我们使用多重连接依赖探针扩增(MLPA)和变性高效液相色谱(DHPLC)结合Sanger测序,在一组119例中国患者中筛查了DMD突变。在这些无亲缘关系的DMD患者中,我们鉴定出11例携带DMD小突变(9.2%)和81例携带DMD缺失/重复(del/dup)(68.1%),其中64例(79.0%)为缺失,16例(19.8%)为重复,1例(1.2%)同时存在缺失和重复。此外,我们通过计算特定外显子间隔的外显子缺失事件,分析了64例缺失病例中DMD断裂点的频率,揭示了一个新的突变热点边界。为了探究为何DMD重排

【数据结构与技术规格】

文件数 4 个,合计 138.09 KB。数据集 DOI:10.1371/journal.pone.0108038。

【主题与分类】

源站学科分类:Uncategorised。主题标签:Duchenne muscular dystrophy、exon interval、DMD breakpoint、Chinese Patients Duchenne、DMD rearrangement breakpoints、dhplc、DMD gene rearrangements、64 deletion cases、DMD mutations、SNP microarray assay。本站分类:肌肉骨骼疾病/其他。

【适用方向】

源站学科分类标注为 Uncategorised。

【获取与许可】

源站页面:https://plos.figshare.com/articles/dataset/Screening_of_Duchenne_Muscular_Dystrophy_DMD_Mutations_and_Investigating_Its_Mutational_Mechanism_in_Chinese_Patients/1177178

使用许可:CC BY 4.0(https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/)。

规范引用:Chen, Chen; Ma, Hongwei; Zhang, Feng; Chen, Lu; Xing, Xuesha; Wang, Shusen; et al. (2016). Screening of Duchenne Muscular Dystrophy (DMD) Mutations and Investigating Its Mutational Mechanism in Chinese Patients. PLOS ONE. Dataset

【使用注意】

· 源站最后修改于 2023-05-30,引用时请注意版本时效。

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curl -L -o "Table_S2.docx" "https://ndownloader.figshare.com/files/1684889"
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curl -L -o "Table_S4.docx" "https://ndownloader.figshare.com/files/1684892"

文件清单

  • Table_S1.docx(13.48 KB)
  • Table_S2.docx(41.23 KB)
  • Table_S3.docx(44.97 KB)
  • Table_S4.docx(38.40 KB)

文件总体积 138.09 KB(源站 API 实测)。

数据说明

杜氏肌营养不良症(DMD)是一种常见的X连锁隐性遗传性肌肉退行性疾病,可导致死亡。为了提供准确可靠的遗传咨询和产前诊断,我们采用多重连接依赖探针扩增(MLPA)和变性高效液相色谱(DHPLC)结合Sanger测序,对119例中国患者的DMD突变进行了筛查。在这些无亲缘关系的DMD患者中,我们鉴定出11例携带DMD小突变(9.2%)和81例携带DMD缺失/重复(del/dup)(68.1%),其中64例(79.0%)为缺失,16例(19.8%)为重复,1例(1.2%)同时存在缺失和重复。此外,我们通过计算特定外显子区间的外显子缺失事件,分析了64例缺失病例中DMD断裂点的频率,揭示了一个新的突变热点边界。为探究DMD重排断裂点为何易集中于特定区域(热点),我们采用高分辨率SNP微阵列检测技术,在核苷酸水平上对21例DMD外显子缺失/重复患者的断裂点连接序列进行了精确表征。

未发现完全重现的断裂点,单外显子缺失/重复与多外显子缺失/重复病例之间也无显著差异。本研究数据为临床实践中检测DMD突变提供了全面的策略,并通过计算特定外显子区间的外显子缺失事件,确定了外显子43–55和外显子10–23两个缺失热点。此外,这是首个在中国人群中以核苷酸水平描述DMD断裂点特征的研究。我们的观察结果有助于更好地理解DMD基因重排的机制。

许可

CC BY 4.0

引用

学术使用请引用 DOI 10.1371/journal.pone.0108038(source: https://plos.figshare.com/articles/dataset/Screening_of_Duchenne_Muscular_Dystrophy_DMD_Mutations_and_Investigating_Its_Mutational_Mechanism_in_Chinese_Patients/1177178)。

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