Sarikaya 肌病历史研究 Orbitrap Elite 蛋白质组数据集

数据集获取

源站：https://omicsdi.org/dataset/massive/MSV000089844

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

该数据集包含4个原始MS文件，这些文件是在Orbitrap Elite质谱仪上以数据依赖采集模式获取的。样本由Ege Sarikaya生成。样本处理由Ege Sarikaya和Cassandra Wong完成。质谱数据采集和数据分析由Cassandra Wong完成。这些文件与Ege Sarikaya等人提交发表的一篇手稿相关。该论文对Mtm1基因敲除小鼠进行了自然史研究，以更好地理解X连锁肌管肌病（XLMTM）的疾病病理机制。James J. Dowling是该手稿的通讯作者（james.dowling@sickkids.ca）；如有关于此数据集的问题，请联系Karen Colwill（colwill@lunenfeld.ca）。本次提交附有3个补充文件（除本README文件外）。表1描述了该数据集的组成。表2列出了所有肽段证据（依据iProphet）。表3列出了SAINTexpress相互作用。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。