骨内破骨细胞亚型的RNA测序数据

该数据集为骨内破骨细胞亚型的RNA测序数据,来源于2周龄C57Bl/6小鼠胫骨的骨髓,经流式细胞术分选获得破骨细胞。数据涵盖VAO和BAO两类亚型,分别对应骨髓中RANK+双核与RANK+四核(及四核以上)的破骨细胞

omicsdi
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基因组分类Transcriptomics
RNA sequencing data of osteoclasts subtypes in bone

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-11

资源简介

骨内破骨细胞亚型的RNA测序数据

该数据集为骨内破骨细胞亚型的RNA测序数据,来源于2周龄C57Bl/6小鼠胫骨的骨髓,经流式细胞术分选获得破骨细胞。数据涵盖VAO和BAO两类亚型,分别对应骨髓中RANK+双核与RANK+四核(及四核以上)的破骨细胞。数据集英文名称为RNA sequencing data of osteoclasts subtypes in bone,主题标签为Transcriptomics,在来源站中归类于肌肉骨骼系统疾病 / 其他。整体而言,该数据集围绕骨组织中不同核数破骨细胞的转录组特征展开,为研究破骨细胞亚型差异提供了RNA测序层面的数据基础。

【数据集背景】

破骨细胞是骨组织中的多核细胞,在骨代谢过程中发挥重要作用。该数据集聚焦于骨内破骨细胞亚型,旨在通过RNA测序手段刻画不同亚型之间的转录组特征。数据集来源于omicsdi.org,其分类归属于肌肉骨骼系统疾病 / 其他,主题标签为Transcriptomics。从来源站描述可知,该数据集的构建基于流式细胞术分选获得的骨髓破骨细胞,并进一步区分出VAO和BAO两类亚型,分别对应RANK+双核与RANK+四核(及四核以上)的破骨细胞。这一背景表明,该数据集可用于探讨破骨细胞在核数差异基础上的分子特征。

【数据内容】

该数据集的核心内容为骨内破骨细胞亚型的RNA测序数据。根据来源站描述,数据涵盖VAO和BAO两类亚型。其中,VAO代表骨髓中RANK+双核破骨细胞,BAO代表骨髓中RANK+四核(及四核以上)破骨细胞。数据集英文名称为RNA sequencing data of osteoclasts subtypes in bone,主题标签为Transcriptomics。除上述亚型划分与测序类型外,源站未提供关于样本数量、测序深度、基因表达矩阵、差异表达结果等更详细的数据内容描述。

【采集与来源】

该数据集的采集对象为2周龄C57Bl/6小鼠胫骨的骨髓。来源站描述指出,研究采用流式细胞术分选骨髓中的破骨细胞,并据此生成该数据集。VAO和BAO分别代表RANK+双核与RANK+四核(及四核以上)的破骨细胞。数据来源站为omicsdi.org。除上述采集物种、年龄、组织来源、分选方式及亚型定义外,源站未提供关于具体实验流程、测序平台、试剂批次、伦理审批等更多采集与来源信息。

【适用场景】

基于该数据集的主题标签Transcriptomics及其破骨细胞亚型划分,其适用场景可围绕骨内破骨细胞亚型的转录组研究展开。例如,可用于比较RANK+双核破骨细胞与RANK+四核(及四核以上)破骨细胞在RNA测序层面的特征差异,或作为肌肉骨骼系统疾病 / 其他分类下相关研究的转录组数据参考。由于数据集来源于2周龄C57Bl/6小鼠胫骨骨髓,并经过流式细胞术分选,其适用场景也与小鼠骨代谢、破骨细胞生物学等方向相关。除上述由数据集名称、分类、标签及来源站描述所支持的范围外,源站未提供更具体的适用场景说明。

【使用方法】

源站未提供关于该数据集使用方法的详细说明,包括但不限于数据下载方式、文件格式、分析流程、标准化处理步骤或配套代码等。因此,无法依据现有信息给出具体的使用操作指引。使用者如需使用该数据集,应参考来源站omicsdi.org提供的相关说明。

【质量与限制】

源站未提供关于该数据集质量评估的详细信息,例如测序质量、数据完整性、批次效应、重复性等。同时,源站也未提供该数据集在样本量、覆盖范围、技术偏差等方面的限制说明。已知信息仅包括数据来源于2周龄C57Bl/6小鼠胫骨骨髓,经流式细胞术分选获得VAO和BAO两类破骨细胞亚型,并进行了RNA测序。除此之外,质量与限制相关内容源站未提供。

【引用与许可】

源站未提供该数据集的引用方式与许可信息。包括但不限于推荐引用文献、数据使用协议、许可类型或使用限制等,均未在现有信息中体现。使用者应前往来源站omicsdi.org查询相关引用与许可要求。

下载信息

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使用方式

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源站:https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-MTAB-6857

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

本数据集使用了从2周龄C57Bl/6小鼠胫骨中通过流式细胞术分选的骨髓破骨细胞。VAO和BAO分别代表来自骨髓的RANK+双核和RANK+四核(及大于四核)破骨细胞。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

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