动态3D MRI量化Pompe病膈肌力学数据集

数据集获取（Figshare）

• 源站标题：Quantification of Diaphragm Mechanics in Pompe Disease Using Dynamic 3D MRI
• DOI：10.1371/journal.pone.0158912
• 发布日期：2016-07-08
• 文件数：9 个
• 文件总体积：32.33 MB
• 源站页面：https://plos.figshare.com/articles/dataset/Quantification_of_Diaphragm_Mechanics_in_Pompe_Disease_Using_Dynamic_3D_MRI/3906585

命令行下载

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curl -L -o "S2 Table.XLSX" "https://ndownloader.figshare.com/files/6117750"
curl -L -o "S1 Video.GIF" "https://ndownloader.figshare.com/files/6117774"
curl -L -o "S2 Video.GIF" "https://ndownloader.figshare.com/files/6117795"
curl -L -o "S1 Data.ZIP" "https://ndownloader.figshare.com/files/6117816"
curl -L -o "S1 Fig.TIF" "https://ndownloader.figshare.com/files/6117858"
curl -L -o "S2 Fig.PDF" "https://ndownloader.figshare.com/files/6117894"
curl -L -o "S3 Fig.PDF" "https://ndownloader.figshare.com/files/6117903"

文件清单

• S1 Table.DOCX（17.85 KB）
• S2 Table.XLSX（197.88 KB）
• S1 Video.GIF（1.37 MB）
• S2 Video.GIF（1.34 MB）
• S1 Data.ZIP（23.36 MB）
• S1 Fig.TIF（616.33 KB）
• S2 Fig.PDF（69.82 KB）
• S3 Fig.PDF（5.36 MB）
• S1 File.ZIP（2.41 KB）

文件总体积 32.33 MB（源站 API 实测）。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

数据说明

背景
膈肌无力是庞贝病患者呼吸功能障碍的主要原因，庞贝病是一种影响呼吸肌和肢带肌的进行性代谢性肌病。由于呼吸衰竭是成年患者死亡的主要原因，因此有必要早期识别呼吸肌受累，以便及时开始治疗并尽可能预防不可逆损伤。本文研究了动态磁共振成像结合先进图像分析方法评估呼吸肌无力的适用性。方法
所提出的方法依赖于图像配准和肺表面提取来量化呼吸过程中的肺运动学。这使得能够提取肺的几何和运动特征，这些特征表征了膈肌和胸肌对呼吸周期的独立贡献。

结果

对16例3D+t MRI扫描（10例Pompe病患者和6例对照者）中缓慢呼气动作的分析结果显示，与常规肺功能检查相比，动态3D图像的运动学分析揭示了关于膈肌力学和呼吸肌受累的重要额外信息。肺功能严重减退的Pompe病患者表现出严重的膈肌无力，表现为膈肌运动幅度极小。在肺功能中度减退的患者中，与健康对照者相比，膈肌后部在充分吸气时的头向位移减小，且膈肌穹隆方向更趋于水平。结论

动态3D MRI为独立分析膈肌和胸廓肌肉的贡献提供了数据。所提出的图像分析方法有潜力检测较轻度的膈肌无力，因此可用于确定成人Pompe病患者的最佳治疗开始时机，以期获得更好的治疗反应。

许可

CC BY 4.0

引用

学术使用请引用 DOI 10.1371/journal.pone.0158912（source: https://plos.figshare.com/articles/dataset/Quantification_of_Diaphragm_Mechanics_in_Pompe_Disease_Using_Dynamic_3D_MRI/3906585）。