PRJNA1512479：pyrin炎症小体感知OCTN2介导的胞外L-肉碱摄取
源站描述显示研究聚焦L-肉碱经OCTN2转运激活pyrin炎症小体，涉及红肉饮食相关慢性炎症及骨骼肌损伤的炎症反应。数据可用于分析相关基因表达变化，支持炎症小体激活机制与肌肉损伤标志物研究（来源 NCBI）
基本信息
资源简介
PRJNA1512479：pyrin炎症小体感知OCTN2介导的胞外L-肉碱摄取
The pyrin inflammasome senses OCTN2-mediated uptake of extracellular ʟ-carnitine from muscle injury or ingestion
该数据集来自NCBI，包含1个文件（GSE343742_series_matrix.txt.gz），主题为高通量测序表达谱分析，物种为小鼠（10090），平台为GPL24247。源站描述显示研究聚焦L-肉碱经OCTN2转运激活pyrin炎症小体，涉及红肉饮食相关慢性炎症及骨骼肌损伤的炎症反应。数据可用于分析相关基因表达变化，支持炎症小体激活机制与肌肉损伤标志物研究（来源 NCBI）。
【数据集背景】
源站首次发布：Aug 13 202。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：含红肉的饮食在流行病学上与慢性炎症性疾病相关，而限制红肉的饮食可改善健康。然而，红肉如何引发炎症尚不确定。在此，我们发现L-肉碱（一种在骨骼肌肌细胞中高度浓缩的氨基酸）可在脂多糖（LPS）攻击的小鼠以及LPS预处理的鼠源和人源巨噬细胞中驱动炎症小体激活。我们发现，胞外L-肉碱抑制甲羟戊酸合成，从而在高亲和力L-肉碱转运体OCTN2介导的细胞输入下游触发pyrin炎症小体激活。我们发现，对骨骼肌损伤的炎症反应也需要pyrin和OCTN2。因此，总之，我们将巨噬细胞鉴定为外源性和内源性胞外L-肉碱的哨兵，其作为骨骼肌细胞损伤的代理指标，并且我们ope
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个，合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签：GPL24247、10090。本站分类：肌肉骨骼系统疾病。
【获取与许可】
源站页面：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE343742
【使用注意】
· 源站最后修改于 Oct 30 202，引用时请注意版本时效。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE343742
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
含红肉的饮食在流行病学上与慢性炎症性疾病相关，而限制红肉的饮食则能改善健康状况。然而，红肉如何引发炎症尚不确定。在此，我们发现，ʟ-肉碱——一种在骨骼肌肌细胞中高度浓缩的氨基酸——在脂多糖（LPS）刺激的小鼠以及LPS预处理的鼠源和人源巨噬细胞中驱动炎症小体活化。我们发现，细胞外ʟ-肉碱抑制甲羟戊酸合成，从而触发pyrin炎症小体的活化，这一过程发生在高亲和力ʟ-肉碱转运体OCTN2介导的细胞输入下游。我们发现，对骨骼肌损伤的炎症反应也需要pyrin和OCTN2。因此，总而言之，我们确定巨噬细胞是外源性和内源性细胞外ʟ-肉碱的哨兵，后者可作为骨骼肌细胞损伤的替代指标，并且我们为研究过量膳食摄入富含肉碱的食物如何驱动炎症性疾病的机制基础开辟了领域。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
需要用于商业化训练或医疗器械注册（NMPA/FDA）？
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连，提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。
