小鼠G-MDSC与ILC2共培养后及对照组的bulk RNA-seq
该数据集为BioProject收录的小鼠G-MDSC（粒细胞样髓系抑制细胞）bulk RNA-seq数据，包含与ILC2（2型固有淋巴细胞）共培养后的G-MDSC以及对照G-MDSC两组样本
基本信息
资源简介
小鼠G-MDSC与ILC2共培养后及对照组的bulk RNA-seq
PRJEB104275 是一个收录于 NCBI BioProject 数据库的转录组学项目，全称为“Bulk RNA-seq of murine G-MDSCs after co-culture with ILC2s and control G-MDSCs”。该项目围绕小鼠粒细胞样髓系抑制细胞（G-MDSC）展开，采用 bulk RNA-seq 技术，对两类细胞样本进行转录组水平的测定：一类是与 2 型固有淋巴细胞（ILC2）共培养后的 G-MDSC，另一类是对照组 G-MDSC。通过两组样本的对比，该项目旨在为研究 ILC2 与 G-MDSC 之间的相互作用提供转录组数据基础。项目在 NCBI BioProject 中以编号 1539133 登记，本站将其归类于肌肉骨骼系统疾病 / 其他类别，主题标签为 Other。
【数据集背景】
BioProject 是 NCBI 提供的一种项目登记形式，用于汇集与某一项单一研究计划相关的各类生物学数据。按照源站描述，一个 BioProject 记录来自单一机构或联合体，并为用户提供一个统一的入口，以便查找该项目所产生的多种数据类型。PRJEB104275 即属于此类登记记录，其研究主题聚焦于小鼠 G-MDSC 在体外与 ILC2 共培养后的基因表达变化。G-MDSC 是一类具有免疫抑制功能的髓系细胞，ILC2 则属于固有淋巴细胞家族，两者之间的细胞间相互作用是免疫调节研究中的关注点之一。该数据集通过 bulk RNA-seq 手段，为刻画共培养条件下 G-MDSC 的转录组特征提供了原始数据支撑。
【数据内容】
该数据集的核心内容是针对小鼠 G-MDSC 的 bulk RNA-seq 测序数据，样本分为两组：实验组为与 ILC2 共培养后的 G-MDSC，对照组为未经共培养处理的 G-MDSC。所谓 bulk RNA-seq，是指对群体细胞进行整体转录组测序，获得的是样本中所有细胞转录本的平均表达信息。数据集所覆盖的具体样本数量、测序深度、读长、比对率、表达矩阵以及差异表达分析结果等细节，源站未提供。除 BioProject 登记信息外，该数据集是否包含原始测序读段、处理后数据或分析结果文件，源站未提供。
【采集与来源】
该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，以 BioProject 形式登记，项目英文名称为“Bulk RNA-seq of murine G-MDSCs after co-culture with ILC2s and control G-MDSCs”，源站标题中带有 ID 1539133。项目涉及的生物样本为小鼠来源的 G-MDSC，实验处理包括与 ILC2 共培养以及对照处理两种条件。关于样本的具体采集时间、地点、小鼠品系、细胞分选方法、培养条件、测序平台及建库策略等信息，源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于免疫学领域中关于髓系抑制细胞与固有淋巴细胞相互作用的转录组研究。具体而言，研究者可利用该数据比较共培养组与对照组 G-MDSC 的基因表达谱，探索 ILC2 对 G-MDSC 转录程序的可能影响，或将其作为相关课题的验证与参照数据。此外，该数据也可用于 bulk RNA-seq 数据分析流程的方法学练习，例如差异表达分析、功能富集分析等。由于本站将其归类于肌肉骨骼系统疾病 / 其他，该数据是否与肌肉骨骼系统疾病存在直接关联，源站未提供，使用者应结合原始项目信息自行判断。
【使用方法】
使用者可通过 NCBI BioProject 数据库，以项目编号 PRJEB104275 或源站标题中的 ID 1539133 进行检索，获取该项目的登记信息及关联数据链接。BioProject 记录本身提供的是项目层面的索引，用户可据此进一步定位该项目所产生的具体数据文件。关于数据下载方式、文件格式、分析流程及所需软件等操作细节，源站未提供，建议参照 NCBI 及相应数据存档平台的一般使用规范执行。
【质量与限制】
该数据集为 BioProject 登记记录，其数据质量取决于原始测序实验与数据处理流程，但具体的质控指标、测序质量评分、批次效应评估等信息，源站未提供。此外，该数据集仅涉及小鼠 G-MDSC 在体外共培养条件下的 bulk RNA-seq，样本类型和实验条件相对有限，结论的外推需谨慎。关于样本量是否充足、是否包含生物学重复、是否存在技术偏差等关键质量信息，源站未提供。
【引用与许可】
该数据集登记于 NCBI BioProject，项目编号为 PRJEB104275。关于该数据的引用方式、许可条款、使用限制以及是否允许再分发等信息，源站未提供。使用者在引用或使用该数据前，应查阅源站页面及相关数据存档平台发布的具体说明。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJEB104275
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
本实验旨在表征小鼠粒细胞系髓源性抑制细胞(G-MDSCs)与2型固有淋巴细胞(ILC2s)相互作用后的转录反应。G-MDSCs从C57BL/6小鼠骨髓中分离，而ILC2s则通过流体动力学基因转移IL-25、IL-33和IL-9表达质粒在体内诱导，随后从脾脏和肠系膜淋巴结中分离。纯化的G-MDSCs与ILC2s采用允许可溶性因子交换而不直接细胞接触的Transwell系统共培养。48小时后，收集G-MDSCs进行批量RNA测序，并与单独培养的G-MDSCs比较，以识别ILC2诱导的转录变化。该数据集为了解G-MDSCs与ILC2s之间通过细胞因子介导的交互作用及其在免疫调节和组织重塑中的潜在作用提供了见解。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
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