WT与Mettl5敲除BMSC成骨诱导后RNA测序数据集

该数据集为WT与Mettl5敲除小鼠原代骨髓间充质干细胞(BMSC)经成骨诱导后的转录组测序数据,来源于NCBI。数据覆盖野生型与Mettl5基因敲除两组样本的RNA seq结果,可用于比较成骨诱导条件下Mettl5缺失对BMSC基因表达谱的影响,支持差异表达分析、成骨分化相关通路与分子机制研究,属

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基因组分类Other
PRJDB43593: RNA seq of WT and Mettl5 knockout BMSC (after osteogenic induction) (PRJCA035536)

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-22

资源简介

WT与Mettl5敲除BMSC成骨诱导后RNA测序数据集

该数据集为野生型(WT)与Mettl5基因敲除小鼠原代骨髓间充质干细胞(BMSC)经成骨诱导后的转录组测序数据,英文名称为“PRJDB43593: RNA seq of WT and Mettl5 knockout BMSC (after osteogenic induction) (PRJCA035536)”,来源于NCBI。数据覆盖野生型与Mettl5敲除两组样本的RNA seq结果,可用于比较成骨诱导条件下Mettl5缺失对BMSC基因表达谱的影响,支持差异表达分析、成骨分化相关通路与分子机制研究。该数据集在站内归类于肌肉骨骼系统疾病/其他,主题标签为Other。

【数据集背景】

骨髓间充质干细胞(BMSC)是具有多向分化潜能的成体干细胞,在成骨分化等过程中发挥重要作用。Mettl5作为一种与RNA修饰相关的基因,其功能缺失对BMSC成骨诱导后基因表达的影响是相关研究关注的问题。该数据集正是围绕野生型与Mettl5敲除小鼠原代BMSC在成骨诱导后的转录组测序展开,为理解Mettl5在成骨分化过程中的作用提供转录组层面的数据基础。源站将其描述为“Transcriptome Sequencing of Primary Bone Marrow Mesenchymal Stem Cells from WT and Mettl5 Knockout Mice after Osteogenesis Induction”。

【数据内容】

数据内容为RNA seq测序结果,样本涵盖野生型与Mettl5基因敲除两组小鼠原代骨髓间充质干细胞,且均经过成骨诱导处理。数据可用于比较两组样本在成骨诱导条件下的基因表达谱差异,进而支持差异表达分析以及成骨分化相关通路与分子机制的研究。关于测序平台、读长、样本数量、数据量等具体技术参数,源站未提供。

【采集与来源】

该数据集来源于NCBI(ncbi.nlm.nih.gov),项目编号为PRJDB43593,同时标注有PRJCA035536。样本材料为WT与Mettl5敲除小鼠的原代骨髓间充质干细胞,在成骨诱导后进行转录组测序。关于样本采集的具体流程、诱导条件、测序建库方法等细节,源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于成骨诱导条件下Mettl5缺失对BMSC基因表达谱影响的比较研究,可用于差异表达分析,以及成骨分化相关通路与分子机制的探索。对于关注骨髓间充质干细胞成骨分化及Mettl5基因功能的转录组研究,该数据可作为分析素材。其他具体应用场景源站未提供。

【使用方法】

使用时可围绕野生型与Mettl5敲除两组样本的RNA seq结果开展组间比较,识别差异表达基因,并结合成骨分化相关通路进行功能层面的分析。关于数据下载方式、文件格式、分析流程与参数设置等,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集为转录组测序数据,样本分组明确为野生型与Mettl5敲除两组,且均处于成骨诱导背景。关于数据质量评估指标、重复设置、批次信息及潜在技术偏差等,源站未提供。使用时应注意仅基于现有分组开展比较,其他限制条件源站未提供。

【引用与许可】

该数据集来源于NCBI,项目编号为PRJDB43593(PRJCA035536)。关于引用方式、许可条款与使用限制,源站未提供。

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使用方式

数据集获取

源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/Traces/study?acc=PRJDB43593

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

本项目是对野生型(WT)和Mettl5基因敲除小鼠的原代骨髓间充质干细胞在成骨诱导后进行转录组测序。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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