斑马鱼脊柱形成中脊索泡吸收压缩性骨生长
脊柱或脊椎围绕脊索杆组装，脊索杆包含由大型空泡化细胞构成的核心。每个空泡化细胞具有单个充满液体的液泡，斑马鱼中这些液泡的丢失或碎裂会导致脊柱扭结
基本信息
资源简介
斑马鱼脊柱形成中脊索泡吸收压缩性骨生长
该数据集围绕斑马鱼脊柱形成过程中脊索空泡的作用展开，英文名称为 Notochord vacuoles absorb compressive bone growth during zebrafish spine formation，归类于肌肉骨骼系统疾病 / 其他。脊柱或脊椎围绕脊索杆组装，脊索杆包含由大型空泡化细胞构成的核心；每个空泡化细胞具有单个充满液体的液泡，斑马鱼中这些液泡的丢失或碎裂会导致脊柱扭结。相关研究识别出激酶基因 dstyk 的突变可引起脊索空泡碎裂，并在斑马鱼中造成严重的先天性脊柱侧弯样表型。该数据集通过活体成像等手段揭示 Dstyk 调控膜与液泡的融合，并说明脊索空泡能够吸收压迫性骨生长，从而维持脊柱正常形态。
【数据集背景】
脊柱的组装依赖脊索杆这一结构，而脊索杆的核心由大型空泡化细胞构成。每个空泡化细胞内部具有单个充满液体的液泡，这些液泡的完整性对脊柱形态至关重要。在斑马鱼中，空泡的丢失或碎裂会导致脊柱扭结。该数据集所对应的研究聚焦于这一过程，旨在阐明脊索空泡在脊柱形成中的功能，尤其是其与压迫性骨生长之间的关系，并识别参与调控空泡维持的关键基因。
【数据内容】
数据集内容涉及对激酶基因 dstyk 突变的分析。该突变会导致脊索空泡碎裂，并在斑马鱼中产生严重的先天性脊柱侧弯样表型。活体成像结果显示，Dstyk 调控膜与液泡的融合。研究还发现，局部破坏脊索空泡会在相应位点引起椎骨畸形和脊柱轴弯曲；在 dstyk 突变体中，随着时间推移，脊柱弯曲逐渐加重，原因是椎骨骨形成对脊索产生不对称压迫，进而导致椎骨畸形和轴线扭结。上述内容构成了该数据集的核心观察与结论范围。
【采集与来源】
该数据集来源于 search.dataone.org。源站描述提供了研究摘要，涵盖脊索空泡、dstyk 突变、活体成像观察以及脊柱弯曲表型等信息。除来源站与上述描述外，关于具体采样地点、样本数量、采集时间、仪器参数等细节，源站未提供。
【适用场景】
基于现有信息，该数据集适用于与斑马鱼脊柱形成、脊索空泡功能、先天性脊柱侧弯样表型相关的研究场景，也可用于关注 dstyk 基因在膜与液泡融合调控中作用的分析。其分类归属为肌肉骨骼系统疾病 / 其他，因此可服务于肌肉骨骼系统疾病相关的基础研究语境。更具体的适用模型、分析流程或临床转化场景，源站未提供。
【使用方法】
源站未提供具体的使用方法、数据格式、文件组织方式或分析步骤。使用者需依据来源站的实际数据说明进行操作。
【质量与限制】
源站未提供关于数据质量评估、误差范围、覆盖度或验证方式的系统说明。已知限制体现在描述范围上：现有信息以研究摘要形式呈现，未涵盖样本量、重复实验、统计方法等细节。因此，对该数据集的质量判断需结合来源站的原始记录，源站未提供进一步的质量与限制说明。
【引用与许可】
该数据集采用 CC0 1.0 Universal (CC0 1.0) Public Domain Dedication 许可。引用方式与作者信息源站未提供。
下载信息
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数据集获取
标准获取流程：
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- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
脊柱围绕脊索棒组装而成，脊索棒内含由大型空泡化细胞构成的核心。每个空泡化细胞具有单个充满液体的液泡，在斑马鱼中这些液泡的丢失或碎裂会导致脊柱扭结。在此，我们鉴定出激酶基因dstyk的一个突变，该突变导致斑马鱼脊索液泡碎裂及严重的先天性脊柱侧弯样表型。活体成像显示，Dstyk调控膜与液泡的融合。我们发现，脊索液泡的局部破坏会在这些部位引起椎骨畸形和脊柱轴线弯曲。相应地，在dstyk突变体中，随着椎骨骨形成对脊索产生不对称压迫，脊柱随时间推移弯曲加剧，导致椎骨畸形和轴线扭结。总之，我们的数据表明，脊索液泡作为流体静力支架，引导椎骨的对称生长和脊柱形成。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
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