nkx3.2突变斑马鱼通过古生代无颌鱼头部形态拟态适应颌关节缺失
该数据集来自search.dataone.org,围绕斑马鱼nkx3.2基因两个独立无效等位基因展开,研究颌关节功能障碍的后果

基本信息
资源简介
nkx3.2突变斑马鱼通过古生代无颌鱼头部形态拟态适应颌关节缺失
nkx3.2 mutant zebrafish accommodate jaw joint loss through a phenocopy of the head shapes of Paleozoic jawless fish
该数据集来自search.dataone.org,围绕斑马鱼nkx3.2基因两个独立无效等位基因展开,研究颌关节功能障碍的后果。突变导致上下颌软骨融合(ankylosis),使斑马鱼功能性无颌,但突变体存活至成年,并通过重塑颅骨和将摄食行为由吸食改为吞食来适应。其头骨形态与古生代无颌脊椎动物(anaspids与furcacaudiid thelodonts)表面相似,包括固定张口、吻部缩短等。数据可用于颅面发育、颌关节疾病及骨骼重塑与发育可塑性研究(来源 DataONE,CC0 1.0 Universal (CC0 1.0) Public Domain Dedication 许可)。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):脊椎动物的颌是多样的摄食器官。为发挥功能,它需要上下颌之间的关节,因此颌关节缺陷往往极具破坏性且难以研究。为描述颌关节功能障碍的后果,我们在斑马鱼中构建了单个颌关节标记基因nkx3.2的两个独立无效等位基因。这些突变通过上下颌软骨融合(ankylosis)使斑马鱼功能性无颌。尽管缺乏颌关节,nkx3.2突变体存活至成年,并通过以下方式适应这一缺陷:a)重塑其颅骨;b)将其行为从吸食改为吞食。因此,nkx3.2突变体发育出的头骨形态表面上类似于在两个古无颌脊椎动物谱系(anaspids和furcacaudiid thelodonts)中观察到的形态,包括:固定张口、吻部缩短和enla
【主题与分类】
主题标签:Craniofacial、jaw、Skeletal remodeling、developmental plasticity、Joint、Agnatha。本站分类:肌肉骨骼系统疾病。
【获取与许可】
源站页面:https://search.dataone.org/view/sha256%3A1b2337a09a195a59bf93f314f6118aca30ce2528c0077e7010d1e36366e9182f
使用许可:CC0 1.0 Universal (CC0 1.0) Public Domain Dedication。
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- OpenDataLab:
数据说明
脊椎动物的颌骨是一种多功能的摄食器官。为发挥功能,它需要在上颌与下颌之间形成关节,因此颌关节缺陷往往具有高度破坏性,且难以研究。为描述颌关节功能障碍的后果,我们在斑马鱼中对单一颌关节标记基因nkx3.2构建了两个独立的无效等位基因。这些突变通过上下颌软骨的融合(关节强直)导致斑马鱼在功能上变为无颌。尽管缺乏颌关节,nkx3.2突变体仍存活至成年,并通过以下方式适应这一缺陷:a)重塑其颅骨;b)将其行为从吸食改为撞击摄食。结果,nkx3.2突变体发育出的颅骨形状在表面上类似于在两个古老无颌脊椎动物谱系(无颌类中的anaspids和furcacaudiid thelodonts)中观察到的颅骨形状,包括:固定的张口状态、缩小的吻部以及扩大的鳃区。然而,这些类群之间在各个颅骨元件上不存在同源性,且突变斑马鱼中大多数被修饰的元件位于nkx3.2已知表达域之外。
因此,我们将成年nkx3.2突变表型解读为并非向祖先状态的逆转,而是由于在无可动颌骨情况下摄食的功能需求相似而导致的趋同演化。这种显著的趋同强烈表明,颌骨运动本身对有颌脊椎动物颅骨的发育具有重大影响。因此,这些突变体提供了一个独特的模型,可用于:a) 研究骨骼发育中对扰动的适应性反应;b) 重新评估由基因敲低和敲除产生的表型模拟的进化启发式解读;以及c) 深入了解已灭绝无颌类的摄食力学机制。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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