肌营养不良症基因-疾病关联数据

该数据集为犬类杜氏肌营养不良症模型的全基因组关联研究补充材料,包含qPCR实验所需的引物与检测方法信息。数据涵盖基因ID、基因名称、基于CanFam3.2的染色体位置及起止坐标,以及TaqMan检测或SybrGreen引物序列、UniGene ID、关联的mRNA与蛋白质序列、qPCR检测位置和预期

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2023-05-31 更新
浏览 6
基因组Muscular dystrophyDuchenne muscular dystrophyDMDGolden retriever muscular dystrophyGRMDModifierLinear mixed-model analysisGene expression
Muscular dystrophy — Gene-Disease Associations

基本信息

模态
基因组
大小
0.000035593 GB
许可
CC BY + CC0
创建/更新时间
2023-05-31
版本
v1

资源简介

肌营养不良症基因-疾病关联数据

Additional file 1: Table S1. of Genome-wide association study to identify potential genetic modifiers in a canine model for Duchenne muscular dystrophy

该数据集为犬类杜氏肌营养不良症模型的全基因组关联研究补充材料,包含qPCR实验所需的引物与检测方法信息。数据涵盖基因ID、基因名称、基于CanFam3.2的染色体位置及起止坐标,以及TaqMan检测或SybrGreen引物序列、UniGene ID、关联的mRNA与蛋白质序列、qPCR检测位置和预期扩增子大小。该数据可用于验证基因表达实验、支持遗传修饰因子研究,并服务于肌营养不良症相关基因的关联分析(来源 figshare,CC BY + CC0 许可)。

【数据集背景】

配套论文《Genome-wide association study to identify potential genetic modifiers in a canine model for Duchenne muscular dystrophy》发表于 BMC Genomics(2016),DOI:10.1186/s12864-016-2948-z。源站首次发布:2016-08-22。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):qPCR实验的引物和检测方法信息。左侧为基因ID及关联的基因名称,其后是基于CanFam3.2的CFA染色体位置(染色体编号)及起始和终止位置(单位bp)。接下来列出用于qPCR的TaqMan检测或SybrGreen引物序列,以及关联的UniGene ID(如有)。其余列标明与所研究基因相关的mRNA和蛋白质序列,以及qPCR检测本身的位置和预期扩增子大小。(XLSX 34 kb)

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 35.59 KB。数据集 DOI:10.6084/m9.figshare.c.3615266_D1.v1。

【主题与分类】

源站学科分类:Genetics、Molecular Biology、Evolutionary Biology、Environmental Sciences not elsewhere classified、Biological Sciences not elsewhere classified、Cancer。主题标签:Muscular dystrophy、Duchenne muscular dystrophy、DMD、Golden retriever muscular dystrophy、GRMD、Modifier、Linear mixed-model analysis、Gene expression。本站分类:肌肉骨骼疾病/其他。

【适用方向】

源站学科分类标注为 Genetics、Molecular Biology、Evolutionary Biology、Environmental Sciences not elsewhere classified、Biological Sciences not elsewhere classified、Cancer。

【获取与许可】

源站页面:https://springernature.figshare.com/articles/dataset/Additional_file_1_Table_S1_of_Genome-wide_association_study_to_identify_potential_genetic_modifiers_in_a_canine_model_for_Duchenne_muscular_dystrophy/4375928

使用许可:CC BY + CC0(https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/)。

规范引用:Brinkmeyer-Langford, Candice; Balog-Alvarez, Cynthia; Cai, James; Davis, Brian; Kornegay, Joe (2016). Additional file 1: Table S1. of Genome-wide association study to identify potential genetic modifiers in a canine model for Duchenne muscular dystrophy. figshare. Dataset

【使用注意】

· 源站最后修改于 2023-05-31,引用时请注意版本时效。

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curl -L -o "12864_2016_2948_MOESM1_ESM.xlsx" "https://ndownloader.figshare.com/files/7102055"

文件清单

  • 12864_2016_2948_MOESM1_ESM.xlsx(35.59 KB)

文件总体积 35.59 KB(源站 API 实测)。

数据说明

qPCR实验的引物和检测信息。左侧为基因ID及关联的基因名称,其后为基于CanFam3.2的CFA染色体位置(染色体编号)以及起始和终止位置(以bp为单位)。接下来列出用于qPCR的TaqMan检测或SybrGreen引物序列,以及相关的UniGene ID(如有)。其余列标明与所研究基因相关的mRNA和蛋白质序列,以及qPCR检测本身的位置和预期扩增子的大小。(XLSX 34 kb)

许可

CC BY + CC0

引用

学术使用请引用 DOI 10.6084/m9.figshare.c.3615266_D1.v1(source: https://springernature.figshare.com/articles/dataset/Additional_file_1_Table_S1_of_Genome-wide_association_study_to_identify_potential_genetic_modifiers_in_a_canine_model_for_Duchenne_muscular_dystrophy/4375928)。

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