表观遗传小分子筛选鉴定改善Duchenne肌营养不良的新HDACi化合物

数据集获取

源站：https://search.dataone.org/view/sha256%3A2479bcfc6f789823f9d9cdcff9ab418b8b6ebcbd645f2871812830652fd4b2a8

标准获取流程：

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2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

这些数据是用于生成手稿《表观遗传小分子筛选鉴定出一种可改善杜氏肌营养不良症的新型HDACi化合物》中图、表及补充信息的原始数据。在本研究中，我们的目标是鉴定对DMD有益的去乙酰化酶抑制剂（HDACi）或其他类别的表观遗传小分子。利用已建立的DMD动物模型——斑马鱼dmd突变株sapje，我们筛选了包含800多种表观遗传小分子的化合物库。我们的筛选鉴定出一种新型HDACi——SR-4370，其可改善dmd突变斑马鱼的骨骼肌退化，同时还鉴定出其他一些此前已被证明可改善dmd斑马鱼的HDACi。我们发现，单次早期HDACi处理即可改善dmd斑马鱼的肌肉表型并延长其寿命。此外，我们发现，可改善dmd肌肉的HDACi处理也会导致斑马鱼幼体组蛋白乙酰化增加。我们的结果……，# 表观遗传小分子筛选鉴定出一种可改善杜氏肌营养不良症的新型HDACi化合物。

研究描述：此处提供的数据是论文《表观遗传小分子筛选鉴定出一种可改善杜氏肌营养不良症的新型HDACi化合物》中各图表所依据的原始数据的原创数据集。在该论文中，我们使用一种已建立的DMD动物模型——斑马鱼sapje品系，筛选了包含800多种表观遗传小分子的化合物库。我们发现，单次早期给予HDACi SR-4370即可改善肌肉表型、延长dmd斑马鱼的寿命并增加组蛋白乙酰化。这些结果支持了小分子筛选在DMD斑马鱼中的有效性，并为越来越多表明HDACi是治疗DMD有前景候选药物的证据增添了新内容。该数据使用相应论文中描述的方法生成。研究领域：生物科学 关键词：杜氏肌营养不良症

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。