MMRC 表达参考数据集

MMRC 表达参考数据集由 omicsdi.org 收录,属于肌肉骨骼系统疾病 / 其他分类,主题标签为 Transcriptomics

omicsdi
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基因组分类Transcriptomics
MMRC expression reference collection

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-08

资源简介

MMRC 表达参考数据集

MMRC expression reference collection 是一个面向多发性骨髓瘤研究社区的基因表达参考数据集,由 omicsdi.org 收录,在本站归类于肌肉骨骼系统疾病 / 其他。该数据集的主题标签为 Transcriptomics,核心内容聚焦于转录组层面的表达谱信息。根据源站描述,这一参考集合整合了基因表达谱分析、阵列比较基因组杂交以及重测序等多种技术路线所产生的数据,旨在为多发性骨髓瘤研究提供可共享、可复用的参考资源。本次提交所代表的是该研究中的转录组组成部分,样本来源于新诊断和复发多发性骨髓瘤患者的 CD138 纯化骨髓细胞。整体而言,该数据集以转录组表达信息为主体,服务于肌肉骨骼系统疾病领域中对多发性骨髓瘤分子特征的研究需求。

【数据集背景】

多发性骨髓瘤是一种涉及骨髓浆细胞的恶性疾病,其分子机制和疾病进展过程需要借助高通量组学手段加以解析。MMRC expression reference collection 正是作为多发性骨髓瘤研究社区的一项参考资源而建立,目标在于为相关研究提供基因表达层面的基础数据。源站描述指出,该参考集合的建立同时涵盖了基因表达谱分析、阵列比较基因组杂交和重测序,说明其设计初衷并非局限于单一技术维度,而是试图从多个角度支撑对多发性骨髓瘤的深入研究。本次提交明确为整个研究中的转录组组成部分,因此其背景与多发性骨髓瘤的转录组研究密切相关。

【数据内容】

该数据集的内容属于转录组范畴,主题标签为 Transcriptomics。源站描述表明,这一参考集合包含基因表达谱分析、阵列比较基因组杂交以及重测序所生成的数据,而本次提交所代表的是其中的转录组组件。就本次提交而言,其数据内容对应的是基因表达层面的信息,样本来自多发性骨髓瘤患者的 CD138 纯化骨髓细胞。关于具体的基因数量、样本数量、表达值范围、平台型号等细节,源站未提供。

【采集与来源】

根据源站描述,该数据集的样本来源为多发性骨髓瘤患者的骨髓细胞,并经过 CD138 纯化处理。患者群体包括新诊断和复发两种情况,这意味着样本覆盖了疾病的不同阶段。数据由 omicsdi.org 收录,本站分类为肌肉骨骼系统疾病 / 其他。关于采集地点、采集时间、伦理审批信息、具体机构名称等,源站未提供。

【适用场景】

该数据集作为多发性骨髓瘤研究社区的参考资源,适用于转录组层面的基因表达研究。由于样本来自新诊断和复发患者,潜在应用场景包括比较不同疾病阶段的表达特征、支持多发性骨髓瘤分子机制探索,以及作为表达参考集合用于相关研究的对照或验证。此外,由于该参考集合整体还涉及阵列比较基因组杂交和重测序,其转录组组件也可能在多组学整合分析中发挥作用。关于具体的分析流程、推荐工具或已验证的应用案例,源站未提供。

【使用方法】

源站未提供该数据集的具体使用方法,包括数据下载方式、文件格式、预处理步骤、标准化方法或配套分析工具等信息。使用者如需利用该数据集,应参考 omicsdi.org 源站所提供的相关说明。

【质量与限制】

源站未提供关于数据质量评估、批次效应、样本量、缺失值处理或技术偏差等方面的具体信息。该数据集明确为参考集合中的转录组组件,其覆盖范围限于本次提交所代表的部分,而非整个 MMRC 参考集合的全部内容。使用者应注意这一范围限制。关于其他质量相关指标,源站未提供。

【引用与许可】

源站未提供该数据集的引用方式、许可协议或使用条款等信息。如需引用或使用该数据集,应查阅 omicsdi.org 源站的相关说明。

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使用方式

数据集获取

源站:https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-GEOD-26760

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

MMRC参考集是一个基因表达谱、阵列比较基因组杂交和重测序的数据集,旨在为多发性骨髓瘤研究界提供资源。该数据集包含来自新诊断和复发多发性骨髓瘤患者的CD138纯化骨髓细胞。此提交代表了研究中的转录组成分。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

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