MMRC aCGH 参考数据集

MMRC aCGH 参考数据集由 omicsdi.org 提供,属于肌肉骨骼系统疾病 / 其他分类。该数据集整合了基因表达谱、阵列比较基因组杂交(aCGH)和重测序数据,样本来自新诊断和复发多发性骨髓瘤患者的 CD138 纯化骨髓细胞

omicsdi
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基因组分类Transcriptomics
基因组MMRC aCGH reference collection

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-08

资源简介

MMRC aCGH 参考数据集

由 omicsdi.org 提供,属于肌肉骨骼系统疾病 / 其他分类,主题标签为转录组学。该数据集整合了基因表达谱、阵列比较基因组杂交(aCGH)和重测序数据,样本来自新诊断和复发多发性骨髓瘤患者的 CD138 纯化骨髓细胞。作为多发性骨髓瘤研究领域的参考资源,它面向该疾病研究社区,旨在为相关研究提供可用的数据基础。整体来看,该数据集覆盖了从基因表达、基因组拷贝数变化到序列变异等多个层面的信息,并以患者来源的骨髓细胞为样本核心,具有明确的疾病指向性和研究支撑价值。

【数据集背景】

多发性骨髓瘤是一种涉及骨髓浆细胞的疾病,相关研究需要多层次的分子数据支持。MMRC aCGH 参考数据集正是作为多发性骨髓瘤研究社区的参考资源而建立,其英文名称为 MMRC aCGH reference collection。该数据集被归类于肌肉骨骼系统疾病 / 其他,主题标签为转录组学,来源站为 omicsdi.org。从定位上看,它服务于多发性骨髓瘤研究领域,通过整合多种类型的分子数据,为研究者提供参考性数据集合。

【数据内容】

该数据集包含基因表达谱、阵列比较基因组杂交(aCGH)和重测序三类数据。基因表达谱用于反映基因转录层面的信息;阵列比较基因组杂交用于检测基因组拷贝数变化;重测序则用于获取序列层面的信息。这三类数据共同构成了一个多组学层面的参考集合。样本方面,数据来自新诊断和复发多发性骨髓瘤患者的 CD138 纯化骨髓细胞。CD138 纯化意味着样本经过特定标记筛选,以富集目标细胞群体。新诊断和复发两种疾病状态均被纳入,使数据集覆盖了不同疾病阶段的患者样本。

【采集与来源】

该数据集的来源站为 omicsdi.org。样本采集对象为新诊断和复发多发性骨髓瘤患者,采集材料为 CD138 纯化骨髓细胞。关于具体的采集时间、采集地点、样本数量、患者人口学信息、伦理审批信息以及具体的实验平台和试剂信息,源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于多发性骨髓瘤研究领域,可作为该研究社区的参考资源。由于包含基因表达谱、阵列比较基因组杂交和重测序数据,它可用于涉及基因表达、基因组拷贝数变化和序列变异的研究场景。样本来自新诊断和复发患者,因此也适用于涉及不同疾病阶段比较的研究。关于具体的分析应用、疾病分型、临床关联研究等详细适用场景,源站未提供。

【使用方法】

该数据集通过 omicsdi.org 提供。关于具体的数据下载方式、文件格式、数据组织方式、访问权限、是否需要注册、配套分析工具或流程等信息,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集作为多发性骨髓瘤研究社区的参考资源,整合了基因表达谱、阵列比较基因组杂交和重测序数据,样本来自新诊断和复发患者的 CD138 纯化骨髓细胞。关于数据质量评估指标、样本量、批次效应、数据完整性、覆盖度、技术偏差以及使用限制等信息,源站未提供。

【引用与许可】

关于该数据集的引用方式、许可协议、使用条款、数据共享政策以及相关发表文献等信息,源站未提供。

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使用方式

数据集获取

源站:https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-GEOD-26849

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

MMRC参考集是一个基因表达谱、阵列比较基因组杂交和重测序的数据集,作为多发性骨髓瘤研究界的资源而创建。来自新诊断和复发多发性骨髓瘤患者的CD138纯化骨髓细胞。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

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