M1极化与未刺激（MФ）骨髓来源巨噬细胞miR表达谱比较

数据集获取

源站：https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-GEOD-33453

标准获取流程：

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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
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数据说明

动脉粥样硬化过程中miR表达谱的全局变化，除了血管细胞中疾病特异性的调控外，还归因于不同类型白细胞浸润至动脉血管壁。单核细胞衍生的巨噬细胞在内膜下区域的积聚对于动脉粥样硬化斑块的形成至关重要。目前尚不清楚哪些miR参与了致动脉粥样硬化的巨噬细胞反应。为了检测M1型巨噬细胞富集的miR，我们比较了LPS/干扰素-γ激活的小鼠巨噬细胞与未刺激的小鼠巨噬细胞中的miR表达谱。这一筛选结合我们在动脉粥样硬化血管中的miR表达谱分析，可能有助于识别动脉粥样硬化血管中M1型巨噬细胞富集的miR，这些miR可能在动脉粥样硬化形成过程中对巨噬细胞功能发挥作用。从6至8周龄雌性C57BL/6小鼠的股骨中采集骨髓细胞，重悬于DMEM-F12/10% FCS/10% L929条件培养基中，培养7天以分化为原代巨噬细胞。通过流式细胞术检测F4/80和CD11b的表达，以确认巨噬细胞表型。

巨噬细胞经LPS（100ng/ml，14小时）和INF-g（10ng/ml，6小时）刺激，并通过qRT-PCR定量甘露糖受体C型1（MRC1）、精氨酸酶II（ArgII）、诱导型一氧化氮合酶（iNOS）和精氨酸酶I（ArgI）来验证M1极化。使用mirVana microRNA分离试剂盒提取总RNA（M1型和未刺激（MФ）巨噬细胞）。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。