Hspg2C1532YNeo DBA 远端肱骨软骨蛋白质组比较数据集
该数据集来源于 omicsdi.org，属于肌肉骨骼疾病 / 其他分类，主题标签为 Proteomics。数据针对小鼠远端肱骨软骨，经 4M GuHCl 物理破碎后提取蛋白质并酶解为肽段，通过 LC-MS/MS 获取质谱数据，并使用 MaxQuant 进行计算机分析，以比较不同发育阶段及 perle
基本信息
资源简介
Hspg2C1532YNeo DBA 远端肱骨软骨蛋白质组比较数据集
Hspg2C1532YNeo DBA Distal Humeral Cartilage Proteomic Comparison Dataset 是一个聚焦于小鼠软骨组织的蛋白质组学数据集，归属于肌肉骨骼疾病 / 其他分类，主题标签为 Proteomics。该数据集围绕小鼠远端肱骨软骨展开，实验流程包括将软骨组织在 4M 盐酸胍（GuHCl）中进行物理破碎，随后提取蛋白质并酶解为肽段，再利用液相色谱-串联质谱（LC-MS/MS）获取质谱数据，并通过 MaxQuant 软件进行计算机分析，以比较不同发育阶段以及 perlecan 敲低条件下的相对蛋白质丰度。该数据集来源于 omicsdi.org，可为研究软骨发育与 perlecan 功能提供蛋白质层面的比较数据。
【数据集背景】
该数据集属于肌肉骨骼疾病 / 其他分类，主题标签为 Proteomics。其研究背景涉及小鼠远端肱骨软骨的蛋白质组学比较，重点关注发育过程以及 perlecan 敲低对蛋白质相对丰度的影响。数据集名称中包含 Hspg2C1532YNeo 与 DBA 等信息，提示其与特定基因改变和品系背景相关。源站描述指出，该研究旨在通过质谱分析比较不同条件下的蛋白质丰度变化，从而为理解软骨发育及相关分子机制提供数据支持。关于该数据集所依托的具体疾病模型、生物学假设或更广泛的临床背景，源站未提供。
【数据内容】
该数据集的核心内容为小鼠远端肱骨软骨的蛋白质组学数据。实验过程中，软骨组织被解剖分离，并在 4M GuHCl 条件下进行物理破碎，随后提取蛋白质并消化为肽段。通过 LC-MS/MS 获得质谱谱图，并利用 MaxQuant 进行计算机分析，最终用于比较不同发育阶段以及 perlecan 敲低条件下的相对蛋白质丰度。数据集的主题标签为 Proteomics，表明其数据类型属于蛋白质组学范畴。关于具体鉴定到的蛋白质数量、肽段数量、定量结果或差异丰度蛋白列表，源站未提供。
【采集与来源】
该数据集来源于 omicsdi.org。根据源站描述，样本为小鼠远端肱骨软骨，采集方式为解剖分离。组织随后在 4M GuHCl 中进行物理破碎，继而完成蛋白质提取与肽段酶解。质谱数据通过 LC-MS/MS 获取，数据分析在计算机中利用 MaxQuant 完成。该数据集的来源站为 omicsdi.org，分类归属于肌肉骨骼疾病 / 其他。关于样本量、生物学重复数、具体小鼠品系、发育阶段划分或实验地点等细节，源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于蛋白质组学相关研究，尤其是针对小鼠软骨组织的比较分析。其设计可用于比较不同发育阶段以及 perlecan 敲低条件下的相对蛋白质丰度，因此可能适用于研究软骨发育、细胞外基质相关蛋白以及 perlecan 功能等方向。主题标签 Proteomics 表明其可被用于蛋白质组学方法学参考或数据再利用。关于该数据集在临床诊断、药物开发或特定疾病机制研究中的具体应用，源站未提供。
【使用方法】
该数据集可通过来源站 omicsdi.org 获取。使用时可参考源站描述的实验流程：小鼠远端肱骨软骨经解剖分离，在 4M GuHCl 中物理破碎，蛋白质提取并酶解为肽段，随后进行 LC-MS/MS 采集，并使用 MaxQuant 进行计算机分析。数据分析的目标是比较不同发育阶段及 perlecan 敲低条件下的相对蛋白质丰度。关于数据文件格式、下载方式、预处理步骤或分析参数等具体信息，源站未提供。
【质量与限制】
该数据集基于 LC-MS/MS 和 MaxQuant 分析流程，源站描述中未提供关于数据质量的具体指标，如覆盖率、重复性、定量准确性或错误发现率等。其样本为小鼠远端肱骨软骨，实验条件涉及 4M GuHCl 物理破碎和酶解，可能对蛋白质提取效率产生影响，但源站未提供相关评估。该数据集仅针对特定组织、特定发育阶段和 perlecan 敲低条件，结论的外推范围有限。关于数据的具体限制、偏差或验证情况，源站未提供。
【引用与许可】
该数据集的来源站为 omicsdi.org。关于引用方式、许可协议、使用条款或原始文献信息，源站未提供。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://omicsdi.org/dataset/massive/MSV000084324
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
从小鼠远端肱骨中分离出软骨，在4M盐酸胍中物理破碎，随后提取蛋白质并酶解成肽段。通过LC-MS/MS获得质谱数据，并使用MaxQuant进行计算机分析，以比较蛋白质相对丰度随发育过程及perlecan敲低的变化。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
需要用于商业化训练或医疗器械注册（NMPA/FDA）？
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连，提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。
