人椎间盘退变中环状RNA表达谱数据集
该数据集来自 NCBI GEO,标题为 GSE67566,针对人椎间盘退变(IDD)中环状 RNA(circRNA)的表达谱进行分析

基本信息
资源简介
人椎间盘退变中环状RNA表达谱数据集
The expression profiling of circular RNAs (circRNA) in human intervertebral disc degeneration (IDD)
该数据集来自 NCBI GEO,标题为 GSE67566,针对人椎间盘退变(IDD)中环状 RNA(circRNA)的表达谱进行分析。数据比较了 IDD 患者来源的髓核组织与尸体椎间盘正常对照的 circRNA 表达情况,样本设计参照此前对 miRNA、lncRNA 和 mRNA 的研究,采用 5 例正常椎间盘和 5 例 IDD 椎间盘。数据集包含 1 个文件,可用于探索 circRNA 在 IDD 中的差异表达及其作为 miRNA 调控节点的潜在作用(来源 NCBI)。
【数据集背景】
源站首次发布:Apr 03 201。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):对人椎间盘退变(IDD)患者来源的髓核与尸体椎间盘来源的正常对照进行环状 RNA 表达谱分析。我们已利用 5 个正常椎间盘作为对照和 5 个 IDD 椎间盘,鉴定了 IDD 中 miRNA(GSE63492)、lncRNA、mRNA(GSE56081)的表达谱。越来越多的证据表明,circRNA 通过与 miRNA 相互作用成为基因表达的关键调控因子。circRNA 是一种新型 RNA,与线性 RNA 不同,它形成共价闭合的连续环,并且在真核转录组中高度丰富。
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签:Non-coding RNA profiling by array、GPL19978、9606。本站分类:肌肉骨骼疾病/其他。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE67566
【使用注意】
· 源站最后修改于 Jan 17 202,引用时请注意版本时效。
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pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
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- OpenDataLab:
数据说明
与来自尸体椎间盘作为正常对照的样本相比,对来自IDD患者的人髓核进行环状RNA表达谱分析。我们利用5个正常椎间盘作为对照和5个IDD椎间盘,已鉴定出IDD中miRNAs(GSE63492)、lncRNAs、mRNAs(GSE56081)的表达谱。越来越多的证据表明,circRNAs通过与miRNAs相互作用而成为基因表达的关键调控因子。circRNA是一种新型RNA,与线性RNA不同,它形成共价闭合的连续环,并在真核转录组中高度表达。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
需要用于商业化训练或医疗器械注册(NMPA/FDA)?
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连,提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。




