人椎间盘退变中环状RNA表达谱数据集

该数据集来自 NCBI GEO,标题为 GSE67566,针对人椎间盘退变(IDD)中环状 RNA(circRNA)的表达谱进行分析

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基因组分类Non-coding RNA profiling by arrayGPL199789606
GSE67566: The expression profiling of circular RNAs (circRNA) in human intervertebral disc degeneration (IDD)

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-11-02

资源简介

人椎间盘退变中环状RNA表达谱数据集

The expression profiling of circular RNAs (circRNA) in human intervertebral disc degeneration (IDD)

该数据集来自 NCBI GEO,标题为 GSE67566,针对人椎间盘退变(IDD)中环状 RNA(circRNA)的表达谱进行分析。数据比较了 IDD 患者来源的髓核组织与尸体椎间盘正常对照的 circRNA 表达情况,样本设计参照此前对 miRNA、lncRNA 和 mRNA 的研究,采用 5 例正常椎间盘和 5 例 IDD 椎间盘。数据集包含 1 个文件,可用于探索 circRNA 在 IDD 中的差异表达及其作为 miRNA 调控节点的潜在作用(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:Apr 03 201。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):对人椎间盘退变(IDD)患者来源的髓核与尸体椎间盘来源的正常对照进行环状 RNA 表达谱分析。我们已利用 5 个正常椎间盘作为对照和 5 个 IDD 椎间盘,鉴定了 IDD 中 miRNA(GSE63492)、lncRNA、mRNA(GSE56081)的表达谱。越来越多的证据表明,circRNA 通过与 miRNA 相互作用成为基因表达的关键调控因子。circRNA 是一种新型 RNA,与线性 RNA 不同,它形成共价闭合的连续环,并且在真核转录组中高度丰富。

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:Non-coding RNA profiling by array、GPL19978、9606。本站分类:肌肉骨骼疾病/其他。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE67566

【使用注意】

· 源站最后修改于 Jan 17 202,引用时请注意版本时效。

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    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

与来自尸体椎间盘作为正常对照的样本相比,对来自IDD患者的人髓核进行环状RNA表达谱分析。我们利用5个正常椎间盘作为对照和5个IDD椎间盘,已鉴定出IDD中miRNAs(GSE63492)、lncRNAs、mRNAs(GSE56081)的表达谱。越来越多的证据表明,circRNAs通过与miRNAs相互作用而成为基因表达的关键调控因子。circRNA是一种新型RNA,与线性RNA不同,它形成共价闭合的连续环,并在真核转录组中高度表达。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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