Grina缺失对HSV-1感染BMDMs基因表达的影响

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE345297

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

为探究Grina在HSV-1诱导的信号通路中的作用，我们从Grina敲除（Grina-KO）骨髓来源巨噬细胞（BMDMs）及其野生型（WT）对照中提取总RNA，分别在有或无HSV-1感染条件下进行。骨髓来源巨噬细胞由Grina-floxed（Grina-fl/fl）和Lyz2-Cre介导的Grina-KO小鼠生成，并以模拟感染或HSV-1感染（MOI = 1）处理4小时。每种条件下提取四个生物学重复的总RNA，代表四个实验组：WT模拟组、WT HSV-1组、KO模拟组和KO HSV-1组。该数据集能够全面鉴定HSV-1感染期间Grina依赖的转录反应，为深入了解Grina介导的信号传导与抗病毒先天免疫之间的交互作用提供了见解。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。