血流诱导的内皮表型转化参与颅内动脉瘤形成

该数据集来自 NCBI GEO(GSE329653),包含 1 个系列矩阵文件,主题为血流诱导的内皮表型转化在颅内动脉瘤中的作用

geo
浏览 6
基因组分类GPL2424710090
GSE329653: Flow induced-endothelial phenotypic transition contributes to Intracranial Aneurysm

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-20

资源简介

血流诱导的内皮表型转化参与颅内动脉瘤形成

Flow induced-endothelial phenotypic transition contributes to Intracranial Aneurysm

该数据集来自 NCBI GEO(GSE329653),包含 1 个系列矩阵文件,主题为血流诱导的内皮表型转化在颅内动脉瘤中的作用。研究通过人单细胞测序发现内皮-间质转化是早期颅内动脉瘤形成的标志特征,并在破裂动脉瘤中明显减弱;结合小鼠动脉瘤模型与体外平行板流室系统,探讨高层流流体剪切应力触发内皮损伤的机制。数据可用于研究颅内动脉瘤发病机制、内皮细胞表型转化及相关基因表达分析(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:Apr 30 202。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):颅内动脉瘤(IAs)破裂是一种危及生命的脑血管事件,具有高发病率和高死亡率。阐明驱动IA起始和进展的病理机制对于开发有效的治疗策略至关重要。已知内皮细胞(EC)功能障碍参与IA的发病机制。血流动力学力——尤其是流体剪切应力(FSS)——是IA发病机制公认的介质,但FSS触发内皮损伤的机制仍不完全清楚。在本研究中,人类单细胞测序揭示内皮-间质转化(EndMT)是早期IA形成的标志性特征,而在破裂动脉瘤中EndMT明显减弱。使用小鼠IA模型和体外平行板流室系统,我们证明暴露于高层流FSS(

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:GPL24247、10090。本站分类:肌肉骨骼系统疾病。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE329653

【使用注意】

· 源站最后修改于 May 05 202,引用时请注意版本时效。

官方服务

专家保障全链路合规授权与标注交付

陕川双基地 × 超十家三甲医院直连

从合规授权、采集治理、专业标注到数据集交付,我们提供全链路闭环服务,让高质量临床数据即拿即用。

⚡️ 需要原始数据或标注支持?联系我们获取定制方案。

帮我联系

下载信息

注册下载

需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。

暂未开放

公开下载

无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。

免登录

有偿下载

公开数据集受托下载与技术交付服务。

提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)

暂未开放

当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

使用方式

数据集获取

源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE329653

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

颅内动脉瘤(intracranial aneurysms,IAs)破裂是一种危及生命的脑血管事件,具有较高的致残率和死亡率。阐明驱动IA发生和进展的病理机制对于开发有效的治疗策略至关重要。已知内皮细胞(endothelial cell,EC)功能障碍参与IA的发病过程。血流动力学力——尤其是流体剪切应力(fluid shear stress,FSS)——是IA发病机制中已确立的介导因素,然而FSS触发内皮损伤的具体机制仍不完全清楚。在本研究中,人类单细胞测序揭示内皮-间质转化(endothelial-to-mesenchymal transition,EndMT)是早期IA形成的标志性特征,而在破裂动脉瘤中EndMT明显减弱。利用小鼠IA模型和体外平行板流动腔系统,我们证明暴露于高层流FSS(high laminar FSS,HSS)可促进内皮细胞发生EndMT,并伴随肌动蛋白细胞骨架重排和Yes相关蛋白(Yes-associated protein,YAP)的核转位。

相比之下,在晚期IA阶段特征性的低流量或涡流(VSS)条件下,内皮细胞发生表型逆转——表现为细胞骨架蛋白表达降低及YAP的胞质隔离。值得注意的是,内皮炎症在整个IA发展过程中逐步加剧,并直接促成持续性的内皮功能障碍。药理学抑制肌动蛋白聚合可有效抑制早期阶段的EndMT,但未能恢复晚期阶段的内皮完整性。综上所述,这些发现确定了FSS–细胞骨架–YAP–EndMT轴为一条阶段特异性、可成药的通路,具有用于颅内动脉瘤疾病早期干预的转化潜力。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

数据缺失?

依托陕西、四川两大基地,我们与超过十家三甲医院建立直接合作关系,覆盖合规授权、采集治理、专业标注、数据交付的全流程,为AI医疗团队提供即拿即用的高质量临床数据。

⚡️ 需要数据支持或标注服务?立即联系我们获取专业方案。

获取专属数据定制方案