人类滑膜组织RNA-seq：骨关节炎、类风湿关节炎、前交叉韧带断裂与半月板撕裂

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE327890

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

对从骨关节炎（OA）、类风湿关节炎（RA）、前交叉韧带断裂（ACLR）和半月板撕裂（MT）患者获取的人类滑膜组织进行了RNA测序（RNA-seq），以表征与滑膜病理相关的转录程序。骨关节炎是一种异质性关节疾病，在滑膜炎症、血管化和纤维化重塑方面表现出显著的可变性。在本研究中，从接受关节手术的患者中采集滑膜组织样本，并进行bulk RNA-seq以分析不同疾病背景下的基因表达。这些转录组数据是作为更广泛研究的一部分而生成的，该研究旨在探究滑膜组织异质性的分子基础及其与组织学结构和疾病严重程度的关系。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。