Runx2-II 足以在缺失 Runx2-I 时支持颅盖、锁骨与四肢骨发育

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE325513

标准获取流程：

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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

Runx2是成骨细胞分化和软骨细胞成熟所必需的转录因子。RUNX2的杂合突变会导致锁骨颅骨发育不良，其特征为囟门未闭、锁骨发育不全和身材矮小。Runx2由两个启动子P1和P2转录，分别产生Runx2-II和Runx2-I。然而，Runx2-I的功能仍不清楚。为阐明其功能，我们通过系统性删除P2区域、同时保留内含子1剪接分支位点下游序列，构建了Runx2-I特异性敲除小鼠。由于2.5 kb和24 kb的缺失并未破坏P2，故将缺失扩展至76 kb（Int1del/+小鼠）。由于该内含子包含Supt3，其纯合缺失在胚胎第9.5-10.5天致死，我们将Int1del/+小鼠与Runx2+/–小鼠杂交。基因表达帽分析显示，Int1del/+Runx2+/–小鼠中Runx2-I mRNA缺失。在新生小鼠颅盖和6周龄股骨中，实时逆转录聚合酶链反应分析显示，Int1del/+Runx2+/–小鼠的Runx2-II mRNA上调至野生型水平，而总Runx2 mRNA与Runx2+/–小鼠相当。

在E16.5和新生儿阶段，骨骼制备及组织学和微型CT分析显示，Runx2+/–小鼠颅骨、锁骨和四肢骨发育受损的情况在Int1del/+Runx2+/–小鼠中得到了恢复，而肋骨、胸骨和椎骨的发育受损则未见恢复。在6周龄雌性小鼠中，Runx2+/–小鼠股骨皮质厚度的减少在Int1del/+Runx2+/–小鼠中得到了恢复。Runx2-I或Runx2-II的过表达均未表现出对内源性表达的负向自我调节。根据所检测的细胞类型不同，它们的过表达或Runx2敲低对P1和P2报告基因活性的影响存在差异，这些活性还受到成骨细胞特异性增强子的影响。这些发现表明，野生型水平的Runx2-II可以在颅盖骨、锁骨中替代Runx2-I。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。