GSE324393：萹蓄及其活性成分杨梅素靶向Yes抑制类风湿关节炎

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE324393

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

类风湿关节炎（RA）是一种以滑膜炎症和关节破坏为特征的慢性自身免疫性疾病。在RA中，成纤维样滑膜细胞（FLS）在炎症细胞因子作用下获得致病表型，促进滑膜炎症和组织破坏。因此，靶向病理性FLS活化已成为一种有前景的治疗策略。本研究旨在鉴定能够抑制滑膜炎症的新型植物来源候选物。通过对327种植物进行筛选，鉴定出萹蓄（Polygonum aviculare L.，PA）是IL-17介导滑膜炎症的有效抑制剂。PA可减轻RA患者来源FLS（RA-FLS）中IL-17、TNF-α和IL-1β介导的病理性反应，并改善动物模型的临床症状和组织病理学改变。转录组分析显示，PA可逆转IL-17诱导的基因表达并抑制炎症相关通路，其中NF-κB成为核心调控轴。基于UHPLC的化合物谱分析结合AI驱动的生物活性预测，鉴定出杨梅素为PA中具有抗炎和NF-κB抑制活性的活性化合物。

杨梅素在RA-FLS中发挥了抗RA作用，且PA和杨梅素均能减轻3D类滑膜微团培养系统中的滑膜炎症。PA和杨梅素靶向Yes并抑制其活性，随后抑制SHP-2磷酸化及下游信号通路。值得注意的是，杨梅素直接结合于Yes的ATP结合位点。这些发现表明，PA和杨梅素通过Yes–SHP-2信号轴抑制致病性反应，并凸显了它们作为植物来源的RA治疗候选物的潜力。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。