再生障碍性贫血骨髓微环境：Nestin/CXCL12免疫组化与RNA测序

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE319656

标准获取流程：

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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
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数据说明

再生障碍性贫血（AA）是一种罕见的骨髓衰竭综合征，其特征为免疫介导的造血干/祖细胞（HSPCs）破坏。骨髓微环境的作用目前仍未完全阐明。我们分析了29例中度（mAA）、重度（sAA）和极重度AA（vsAA）患者的骨髓活检标本，以及12例健康对照和7例皮质下假性细胞减少样本。采用nestin和CXCL12免疫组化染色以量化基质龛。通过RNA测序研究免疫及龛相关基因表达模式。与mAA患者和对照组相比，sAA患者的nestin+龛数量显著增加。CXCL12+龛在各组间无显著差异。RNA测序显示免疫应答基因上调，以及与干扰素-γ信号通路、JAK-STAT3激活和抗原呈递相关的通路上调。下调的基因和通路则指向DNA修复、细胞周期调控和表观遗传稳定性受损。

我们的研究结果支持这样一个模型：AA的发病机制既由免疫损伤驱动，也由代偿性但功能失调的基质重塑驱动。这些数据强调了骨髓微环境在AA中的重要性。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。