巨噬细胞EHD1促进炎症并稳定sortilin加速动脉粥样硬化[RNA-Seq]

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE319027

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数据说明

巨噬细胞是动脉粥样硬化发病机制中的关键角色。本研究探讨了内吞调节因子EHD1在巨噬细胞免疫应答中的作用，并确定其对动脉粥样硬化进展的贡献。通过单细胞RNA测序（sc-RNA-seq）和免疫荧光染色确定了小鼠和人斑块中EHD1的表达谱。通过将Ehd1−/−或同窝野生型小鼠的骨髓细胞移植至经照射的Ldlr−/−小鼠中进行骨髓移植（BMT），以确定EHD1缺失对动脉粥样硬化进展的影响。在骨髓来源的巨噬细胞中进行了包括炎症信号传导和内吞检测在内的体外机制研究。随着动脉粥样硬化在小鼠和人类中的进展，巨噬细胞中EHD1的表达增强。主动脉CD45+细胞的sc-RNA-seq表明，EHD1缺失减弱了促炎反应和细胞间相互作用。机制研究揭示，EHD1加速TNFR2的内吞循环再利用并激活NF-kB，导致炎症细胞因子表达增加。

此外，EHD1与逆转录体相互作用并稳定分选蛋白，后者是逆转录体的逆行货物，也是动脉粥样硬化的风险因素。我们的研究揭示了EHD1介导的膜运输在巨噬细胞功能中的新作用，并为针对动脉粥样硬化中膜运输失调的创新治疗策略铺平了道路。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。